肛瘘治疗包括非手术和手术治疗，非手术治疗仅作辅助或暂时缓解症状，如坐浴、抗感染等；手术是根治主要方法，有瘘管切开术（适单纯性低位肛瘘）、挂线疗法（适高位单纯性或复杂性肛瘘）、肛瘘切除术（适低位单纯性肛瘘），医生依肛瘘情况选术式，术前后需关注患者一般情况，术后要保持清洁、定期换药等促进愈合降复发风险。
一、非手术治疗
非手术治疗一般仅作为辅助治疗或暂时缓解症状，无法根治肛瘘。主要包括：
坐浴：可使用温水或1：5000高锰酸钾溶液坐浴，每天1-2次，每次10-15分钟，能改善局部血液循环，保持局部清洁，减轻炎症反应。对于急性期炎症较轻的肛瘘患者有一定缓解作用，但不能治愈肛瘘。
抗感染治疗：当肛瘘出现急性感染、红肿疼痛时，可根据病情选用抗生素抗感染。如存在细菌感染证据时，可短期使用抗生素控制感染，但单纯抗感染不能根治肛瘘，且长期使用抗生素可能导致耐药等问题。
二、手术治疗
手术是根治肛瘘的主要方法，其原理是将瘘管切开或切除，形成开放的创面，促进愈合。常见的手术方式有：
瘘管切开术：适用于单纯性低位肛瘘。手术将瘘管全部切开，靠肉芽组织生长使伤口愈合。该手术操作相对简单，术后恢复相对较快，但对于高位肛瘘不适用，因为可能会损伤括约肌导致肛门失禁。
挂线疗法：适用于高位单纯性肛瘘或高位复杂性肛瘘。利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械压迫作用，缓慢切开肛瘘。挂线过程中可减少对括约肌的损伤，避免一次性切断括约肌导致肛门失禁，同时能引流瘘管，促进愈合。一般挂线后10-14天左右线会脱落。
肛瘘切除术：适用于低位单纯性肛瘘。将瘘管及其周围的炎性组织一并切除，然后缝合创面。该手术可以彻底切除病灶，但对于创面较大的情况，术后恢复时间可能较长，且需要注意防止感染等并发症。
不同的手术方式适用于不同类型的肛瘘，医生会根据肛瘘的位置（高位、低位）、复杂程度（单纯性、复杂性）等因素来选择合适的手术方式。在手术治疗前后，都需要注意患者的一般情况，如年龄较小的患儿，身体各器官功能尚未发育完全，手术耐受性相对较差，需要更加精细的术前评估和术后护理；对于老年患者，可能合并有其他基础疾病，如心血管疾病、糖尿病等，需要在控制基础疾病的情况下进行手术，并密切监测术后恢复情况，预防并发症的发生。同时，术后患者需要注意保持肛门局部清洁，定期换药，避免剧烈运动等，以促进伤口愈合，降低肛瘘复发的风险。
