肛瘘诱因包括肛门腺感染致炎症蔓延形成瘘，直肠肛门外伤或医源性损伤可引发，结核杆菌、溃疡性结肠炎、克罗恩病等特定疾病可影响，便秘使粪便干结损伤黏膜增感染几率，腹泻频繁刺激肛门易引发炎症，且青壮年男性多见、男性发病率高于女性。
一、肛门腺感染
肛窦形似口袋，开口向上，粪便易积存其中，且易受损伤，细菌（如大肠杆菌等）易侵入肛窦引发肛腺炎。炎症向周围蔓延可形成肛周脓肿，脓肿自行破溃或经切开引流后，脓腔逐渐缩小，腔壁纤维组织增生形成瘘管，即肛瘘。此为肛瘘最常见的诱因，约占肛瘘发病原因的大部分。
二、直肠肛门损伤
1.外伤因素：外界暴力如异物刺伤、金属异物（如吞咽后滞留于直肠肛门部位）、骨骼等损伤直肠肛门，细菌可经损伤处侵入，引发感染，进而形成肛瘘。
2.医源性损伤：内痔注射时操作不当，药物注入过深或位置错误，可导致感染；直肠周围手术（如直肠癌手术、直肠息肉切除术等）后，若护理不当，也可能引发感染，从而形成肛瘘。
三、特定疾病影响
1.结核杆菌感染：结核杆菌可侵袭肛窦、肛腺导管，引发结核性炎症，炎症持续发展可形成肛瘘。此类肛瘘病程通常较长，病变相对复杂，治疗难度较大。
2.溃疡性结肠炎：炎症累及直肠及肛管时，反复的炎症刺激会破坏局部组织，增加肛瘘的发生风险。炎症长期存在导致肠黏膜及周围组织处于炎症状态，易引发感染及组织破坏，进而形成肛瘘。
3.克罗恩病：这是一种慢性炎性肉芽肿性疾病，可累及胃肠道各部位，当病变累及肛门直肠时，易出现肛周病变，包括肛瘘。其肛瘘特点往往较为复杂，与克罗恩病本身的肠道炎症及免疫异常等因素相关，炎症蔓延可导致肛周组织感染、坏死，形成肛瘘。
四、生活方式因素
1.便秘：长期便秘使粪便干结，排便时易损伤肛管直肠黏膜，细菌易侵入损伤部位引发感染。粪便长时间堆积在肠道内，局部细菌滋生，增加了肛窦及肛腺感染的几率，进而可能发展为肛瘘。
2.腹泻：长期腹泻会频繁刺激肛门局部，使肛门周围组织处于充血、炎症状态，易引发炎症反应，增加肛瘘发生的可能性。肠道内的病菌随腹泻频繁排出，对肛门局部的刺激及感染风险升高。
五、年龄与性别差异
1.年龄：任何年龄段均可发病，但以青壮年男性多见。青壮年男性肛腺发达，分泌旺盛，肛腺感染的几率相对较高，且青壮年活动量较大，可能增加直肠肛门损伤及感染的机会。
2.性别：男性发病率高于女性，可能与男性的生理结构（如肛腺分布特点等）及生活习惯（如社交活动、工作等因素导致的局部感染风险差异）有关。
