非淋性尿道炎反复的原因主要包括治疗不彻底、不良生活习惯、免疫力下降、局部感染、再感染等。
1.治疗不彻底
如果患者在治疗过程中没有按照医生的嘱咐足量、足疗程用药，或者自行随意停药、减药，就很难将病原体彻底清除。病原体在体内残留，一旦时机合适就会再次繁殖，导致炎症复发。此外，部分患者可能存在耐药性问题，所用药物对感染的病原体不敏感，也会使治疗不彻底，进而引起病情反复。
2.不良生活习惯
一些不良的生活习惯会增加非淋性尿道炎复发的风险，比如不注意个人卫生，性生活前后没有做好清洁工作，容易导致病原体再次入侵尿道引发感染。还有些患者在患病期间或治愈后依然保持着吸烟、酗酒、熬夜等习惯，这些习惯会降低身体的抵抗力，影响尿道黏膜的修复，使得尿道更容易受到病原体的侵袭，导致炎症反复。
3.免疫力下降
当身体免疫力下降时，机体对病原体的抵抗能力减弱，无法有效抑制病原体的生长和繁殖，从而容易导致非淋性尿道炎复发。引起免疫力下降的原因有很多，如长期过度劳累、精神压力过大、患有慢性疾病、营养不良等，这些因素都会使身体处于虚弱状态，给病原体可乘之机。
4.局部感染
尿道周围的器官或组织发生感染，也可能导致非淋性尿道炎反复。例如，前列腺炎、精囊炎、宫颈炎等邻近部位的感染，其病原体可能会蔓延至尿道，引起尿道炎症的复发。此外，尿道黏膜受到损伤后，局部的防御功能下降，也容易受到病原体的感染，导致病情反复。
5.再感染
再感染也是非淋性尿道炎反复的一个重要原因，非淋性尿道炎主要通过性接触传播，如果患者在治愈后没有注意性生活卫生，与携带病原体的伴侣发生无保护性行为，就很容易再次感染病原体，导致疾病复发。另外，如果伴侣没有同时接受治疗，即使患者自身治愈，也可能会被伴侣再次传染，造成病情反复。
