癫痫病因包括具有遗传易感性及特定基因突变可增发病可能的遗传因素，脑部疾病中胚胎期受不良因素致脑发育异常、颅脑外伤、颅内感染、脑血管病、脑肿瘤可引发，全身或系统性疾病里代谢紊乱及药物中毒等能导致癫痫发作。
一、遗传因素
癫痫具有一定遗传易感性，若家族中有癫痫患者，亲属患病风险较普通人群增高。某些特定基因突变可使神经元异常放电的阈值降低，从而增加癫痫发生的可能性，比如常染色体显性遗传夜间额叶癫痫相关的基因变异等，遗传因素在癫痫的发病中占比较重要地位，尤其在一些儿童及青少年起病的癫痫类型中较为突出，如婴儿痉挛症等可能与遗传因素关联密切。
二、脑部疾病
1.先天性脑发育异常：胎儿在胚胎发育时期受到感染、放射线照射等不良因素影响，可出现大脑灰质异位症、脑穿通畸形、先天性脑积水等，这些脑部结构的异常会干扰正常神经电生理活动，导致神经元异常同步化放电引发癫痫。
2.颅脑外伤：头部受到外力撞击等造成颅脑损伤，如急性期颅内血肿压迫、脑挫裂伤后水肿等，后期脑萎缩导致大脑供血供氧不足、脑组织瘢痕形成等，都可能成为癫痫的致病因素，多见于交通事故、高处坠落等导致的颅脑外伤患者。
3.颅内感染：各种病原体引起的脑炎、脑膜炎、脑脓肿等颅内感染性疾病，炎症刺激可使大脑神经元兴奋性增高，引发癫痫发作，例如单纯疱疹病毒性脑炎、结核性脑膜炎等感染性疾病在病情恢复后仍可能遗留癫痫后遗症。
4.脑血管病：脑出血、脑梗死、蛛网膜下腔出血等脑血管病变，会导致脑部血液循环障碍、脑组织缺血缺氧或神经细胞损伤，进而诱发癫痫，尤其脑梗死病灶累及皮层或皮层下时更易出现癫痫发作，中老年人群中因脑血管病引发癫痫的情况较为常见。
5.脑肿瘤：颅内肿瘤不断生长压迫周围脑组织，影响神经组织的正常功能，同时肿瘤细胞可释放异常化学物质，刺激神经元异常放电，如胶质瘤、脑膜瘤等脑肿瘤患者中，部分会出现癫痫症状。
三、全身或系统性疾病
1.代谢紊乱：低血糖时，大脑能量供应不足，影响神经细胞正常功能，可导致癫痫发作；低血钙会使神经肌肉兴奋性增高，也可能引发癫痫；尿毒症患者由于体内代谢废物堆积，内环境紊乱，容易出现癫痫；甲状旁腺功能减退导致血钙降低，同样可诱发癫痫等。
2.药物及中毒因素：某些药物使用不当可能诱发癫痫，如中枢神经系统兴奋药物、抗精神病药物等；一氧化碳中毒、有机磷农药中毒等中毒情况，会影响神经系统正常代谢和功能，进而引发癫痫发作。
