尿道结石有多种症状，包括疼痛（排尿痛、会阴阴囊部疼痛）、排尿困难、血尿、尿道分泌物增多以及局部压痛。疼痛有排尿痛且可放射，结石嵌顿时会阴阴囊部剧痛；结石阻塞致排尿困难，严重可尿潴留；结石摩擦致血尿，可为镜下或肉眼；刺激黏膜致分泌物增多，合并感染时量多质稠；检查可发现结石部位有明显压痛。
排尿痛：结石在尿道内移动时，会刺激尿道黏膜，引起排尿疼痛，疼痛程度可轻可重，有时呈刺痛或灼痛，疼痛可放射至阴茎头部。例如，前尿道结石患者排尿时疼痛部位多在阴茎头部或尿道外口，后尿道结石疼痛可放射至会阴部或阴囊部。儿童患者由于表达能力有限，可能表现为哭闹不安、排尿时躁动等。
会阴、阴囊部疼痛：当结石嵌顿在尿道某个部位时，可引起会阴、阴囊部剧烈疼痛，疼痛呈持续性，患者常坐立不安，难以平卧。
排尿困难
结石阻塞尿道可导致排尿困难，表现为尿线变细、射程变短，甚至出现尿滴沥。严重时可发生急性尿潴留，即完全不能排尿。对于男性患者，由于尿道有两个生理狭窄（尿道内口、尿道外口）和一个生理弯曲（耻骨下弯），结石更容易在这些部位嵌顿而引起排尿困难。老年男性患者本身可能存在前列腺增生的基础情况，尿道结石合并前列腺增生时，排尿困难症状可能更明显。
血尿
结石摩擦尿道黏膜可导致黏膜损伤出血，从而出现血尿。血尿可为镜下血尿，也可为肉眼血尿，表现为尿液颜色发红。例如，排尿终末时尿道结石患者可能出现终末血尿，这是因为结石在尿道末端，排尿末时尿道肌肉收缩挤压结石，导致黏膜损伤出血。儿童患者出现血尿时，家长应高度重视，及时带孩子就医检查。
尿道分泌物
尿道结石刺激尿道黏膜，可导致尿道分泌物增多。分泌物可为黏液性或脓性，若合并感染，分泌物量会增多，且质地可能变稠。例如，合并尿道感染时，分泌物可呈脓性，伴有尿道瘙痒、灼热等不适症状。
局部压痛
医生在检查时可发现尿道结石所在部位有明显压痛。例如，前尿道结石可在阴茎阴囊交界处的尿道部位触及硬结，按压时有明显疼痛；后尿道结石可通过直肠指检触及，有压痛感。不同年龄、性别的患者在检查时需注意操作的轻柔性和准确性，儿童患者更需避免过度用力造成不必要的损伤。
