尿道结石有多种症状，疼痛表现为排尿痛及会阴、阴囊部疼痛；排尿异常包括排尿困难、尿频尿急；有镜下或肉眼血尿；还有少量黏液性或血性分泌物，不同人群症状可能有差异。
排尿痛：结石在尿道内移动时，会引起尿道的疼痛，疼痛程度可轻可重，有的患者表现为刺痛，有的则是较为剧烈的胀痛。在排尿过程中，疼痛往往会更加明显，这是因为结石刺激尿道黏膜，同时尿液的流动会推动结石，从而加重疼痛感觉。例如，前尿道结石患者在排尿时，疼痛会局限在结石部位，而后尿道结石引起的排尿痛可能会放射至会阴部或阴茎头部。
会阴、阴囊部疼痛：后尿道结石的患者，除了排尿痛外，还可能出现会阴、阴囊部的疼痛，这是由于结石刺激后尿道及周围组织导致的牵涉痛。
排尿异常
排尿困难：结石堵塞尿道会阻碍尿液的排出，导致排尿困难。患者表现为尿线变细、射程变短，甚至出现尿流中断的情况。比如，较小的结石可能部分堵塞尿道，使得尿液排出不顺畅，需要用力才能排出尿液；而较大的结石完全堵塞尿道时，可能会出现尿潴留，即完全无法排尿。
尿频、尿急：结石刺激尿道黏膜，会引起尿道的频繁收缩，导致患者出现尿频、尿急的症状。患者总是感觉有尿意，而且迫不及待地想要排尿，但每次尿量不多。这是因为尿道受到结石刺激后，感受器频繁向中枢传递排尿信号，同时尿道的不自主收缩也影响了正常的排尿控制。
血尿
镜下血尿或肉眼血尿：结石在尿道内移动时，会损伤尿道黏膜，导致黏膜出血。这种出血有的可以通过显微镜观察到，即为镜下血尿；有的出血量较多时，患者可以看到尿液呈红色，也就是肉眼血尿。例如，当结石摩擦尿道黏膜较严重时，就可能出现肉眼可见的血尿。
尿道分泌物
少量黏液性或血性分泌物：尿道结石刺激尿道黏膜，会导致尿道腺体分泌增加，同时黏膜受损出血，从而出现少量的黏液性或血性分泌物。患者可能会发现尿道口有少量的分泌物，有时是透明的黏液样，有时带有血丝。
不同年龄、性别、生活方式和病史的人群，尿道结石的症状可能会有一些差异。例如，儿童尿道结石相对较少见，若发生，除了上述一般症状外，可能因儿童表达能力有限，更多表现为排尿时的哭闹等异常行为；女性尿道较短且宽，尿道结石相对男性少见，但一旦发生，症状可能与男性类似，但需要考虑女性特殊的生理结构对症状的影响；有尿道狭窄病史的患者，发生尿道结石时，症状可能会更严重，因为狭窄的尿道会加重结石对尿道的梗阻和刺激，导致疼痛、排尿困难等症状更为明显；长期饮水过少、饮食中钙摄入过多等不良生活方式的人群，更容易发生尿道结石，且症状可能相对更典型地表现出上述各种症状。
