牙齿矫正可能存在多种危害，包括牙齿松动（矫正力度不当等可致，不同年龄耐受不同）、牙龈问题（如牙龈萎缩，因口腔卫生不佳等；牙龈红肿出血，因矫正装置刺激及口腔清洁难等）、牙根吸收（矫正力等因素致，不同年龄及特殊病史人群风险不同）、口腔溃疡（矫正装置摩擦黏膜致，特定人群更易出现）、影响颞下颌关节（咬合关系不稳定致，特定人群影响更大）。
牙龈问题
牙龈萎缩：如果牙齿矫正过程中口腔卫生维护不佳，菌斑、牙石等刺激牙龈，可能导致牙龈萎缩。因为牙齿移动时，牙龈组织需要适应牙齿位置的变化，如果口腔清洁不到位，细菌滋生会破坏牙龈组织。例如，长期佩戴矫正器的患者，如果不能有效刷牙、使用牙线等清洁口腔，就容易出现牙龈炎症，进而发展为牙龈萎缩。不同生活方式的人群，如口腔卫生习惯差的人，在牙齿矫正过程中牙龈萎缩的风险更高；有吸烟习惯的人，烟草中的有害物质会加重牙龈的炎症反应，增加牙龈萎缩的发生几率。
牙龈红肿出血：矫正装置如托槽、钢丝等会对牙龈造成一定的刺激，在矫正初期，很多患者会出现牙龈红肿、刷牙或进食时出血的情况。这是因为矫正器的存在使得口腔清洁难度增加，食物残渣容易堆积在矫正装置周围，刺激牙龈组织。青少年在牙齿矫正过程中，由于生长发育阶段口腔环境相对更易受到影响，牙龈红肿出血的情况可能相对更常见；而患有牙周炎等病史的人群，本身牙龈就处于比较脆弱的状态，在牙齿矫正时更容易出现牙龈红肿出血的问题。
牙根吸收：较少见但存在一定风险，牙齿矫正过程中，牙根会发生生理性吸收，这是正常的改建过程，但如果吸收过度，可能导致牙根变短，影响牙齿的稳固性。牙根吸收的发生与矫正力的大小、持续时间以及个体的牙根结构等因素有关。例如，矫正力过大时，牙根吸收的速度可能会加快。不同年龄的人牙根结构有所不同，儿童的牙根相对较短，根尖孔未闭合，在牙齿矫正时牙根吸收的情况可能与成人不同；有某些特殊病史，如遗传性牙根发育异常的人群，牙根吸收的风险可能更高。
口腔溃疡：矫正装置的钢丝、托槽等可能会摩擦口腔黏膜，导致口腔溃疡。尤其是在矫正初期，口腔黏膜还没有适应矫正装置，更容易被摩擦受伤。不同性别在牙齿矫正过程中出现口腔溃疡的几率并无明显差异，但如果本身有口腔黏膜疾病的人群，如复发性阿弗他溃疡患者，在牙齿矫正时口腔溃疡的发生可能会更频繁。生活方式中经常食用辛辣、刺激性食物的人，可能会加重口腔溃疡的症状。
影响颞下颌关节：牙齿矫正后咬合关系发生改变，如果新的咬合关系不稳定，可能会影响颞下颌关节的功能，导致颞下颌关节疼痛、弹响等问题。例如，矫正后咬合关系调整不当，在咀嚼、张口闭口时，颞下颌关节承受的压力不均衡，就可能出现关节问题。年龄较小的人群，颞下颌关节还在发育中，牙齿矫正对其影响可能相对更大；有颞下颌关节病史的人，进行牙齿矫正时需要更加谨慎评估，因为本身关节就存在问题，矫正后更易诱发颞下颌关节的不适。
