窦性心动过缓的原因包括生理性因素（运动员、长期重体力劳动者及睡眠状态时的窦性心动过缓）、病理性因素（心血管系统疾病如冠心病、心肌病；内分泌系统疾病如甲状腺功能减退症、高钾血症；神经系统疾病如颅内病变、迷走神经张力增高）、药物因素（β受体阻滞剂、钙通道阻滞剂可致窦性心动过缓）以及特殊人群情况（老年人心脏传导系统退行性变及合并基础疾病易发生，儿童存在先天性心脏结构异常等情况可出现）。
睡眠状态下，人体迷走神经兴奋，会导致窦性心动过缓，这是正常的生理调节过程，睡眠时身体代谢降低，对心率的需求减少，迷走神经兴奋使心率减慢以适应机体能量消耗减少的状态。
病理性因素
心血管系统疾病
冠心病：冠状动脉粥样硬化导致血管狭窄、供血不足，心肌缺血缺氧，可影响心脏的电生理活动，引起窦性心动过缓。例如，冠状动脉狭窄使心肌细胞的氧供减少，心肌细胞的电活动稳定性受到影响，窦房结发放冲动的频率可能降低，从而出现窦性心动过缓。
心肌病：如扩张型心肌病，心肌发生病变，心肌收缩和舒张功能受损，心脏的正常电传导和心率调节受到影响，可导致窦性心动过缓。心肌的病变会干扰窦房结的正常功能，使其发放冲动的频率减慢。
内分泌系统疾病
甲状腺功能减退症：甲状腺激素分泌不足，机体代谢率降低，交感神经兴奋性下降，心率减慢。甲状腺激素对维持机体的正常代谢和心率有重要作用，缺乏时会使心率减慢，患者常伴有乏力、怕冷、水肿等表现。
高钾血症：血钾浓度升高可抑制心肌细胞的兴奋性和传导性，影响窦房结的功能，导致窦性心动过缓。严重的高钾血症还可能引起心脏传导阻滞等更严重的心律失常，血钾过高时，心肌细胞的电活动受到抑制，窦房结发放冲动的频率降低。
神经系统疾病
颅内病变：如颅内肿瘤、脑出血、脑梗死等病变累及颅内的自主神经中枢，影响心率的调节，可出现窦性心动过缓。例如，颅内肿瘤压迫或侵犯相关神经中枢，干扰了正常的神经信号传导，导致对心脏心率调节的异常。
迷走神经张力增高：某些情况下，如颈部手术、外伤等刺激迷走神经，使其张力增高，导致窦性心动过缓。颈部的手术或外伤可能直接刺激迷走神经，使其兴奋过度，引起心率减慢。
药物因素
β受体阻滞剂：如普萘洛尔等，这类药物通过阻断β受体，抑制心肌的兴奋-收缩偶联，降低心肌耗氧量，同时也会影响窦房结的功能，导致窦性心动过缓。长期使用β受体阻滞剂的患者需要密切监测心率情况。
钙通道阻滞剂：像维拉帕米等，可抑制心肌细胞的钙内流，降低心肌收缩力，影响窦房结的自律性，从而引起窦性心动过缓。在使用钙通道阻滞剂治疗心血管疾病时，要注意观察患者的心率变化。
特殊人群情况
老年人：老年人的心脏传导系统可能出现退行性变，窦房结功能减退，更容易发生窦性心动过缓。同时，老年人常合并多种基础疾病，如冠心病、高血压等，这些疾病也增加了窦性心动过缓的发生风险。应定期进行心脏检查，关注心率变化。
儿童：儿童窦性心动过缓相对较少见，但如果存在先天性心脏结构异常等情况，也可能出现。例如先天性房室传导阻滞的儿童，窦房结发放冲动传导至心室的过程受阻，可表现为窦性心动过缓。对于儿童窦性心动过缓，需要进一步检查明确病因，因为儿童的心脏处于发育阶段，任何心脏异常都可能对其未来生长发育产生影响。
