基孔肯雅热可能会昏迷，与病毒侵袭中枢神经系统、严重免疫反应损伤、多器官功能衰竭等有关。
1.病毒侵袭中枢神经系统
基孔肯雅病毒具有嗜神经性，可突破血-脑屏障进入中枢神经系统，直接侵犯大脑、脑干等重要部位。病毒在神经细胞内大量繁殖，破坏神经细胞的结构和功能，干扰神经信号的正常传导，影响大脑对全身的调控，进而导致意识障碍，严重时引发昏迷。
2.严重免疫反应损伤
感染病毒后，人体免疫系统会过度激活，产生大量炎症因子。这些炎症因子可广泛损伤全身各器官组织，包括中枢神经系统，导致脑水肿、颅内压升高，压迫脑组织，影响脑的血液供应和代谢，最终造成昏迷。
3.多器官功能衰竭
基孔肯雅热若引发多器官功能衰竭，如肝、肾、心等重要器官功能严重受损，会导致体内代谢紊乱、毒素堆积，这些有害物质可影响大脑功能，引起脑代谢障碍，从而导致患者陷入昏迷状态。
