卵泡小的原因包括内分泌失调（下丘脑-垂体功能异常、卵巢自身内分泌问题）、遗传因素（染色体异常）、生活方式因素（过度节食、长期精神压力过大）、疾病因素（甲状腺疾病、高泌乳素血症）。
卵巢自身内分泌问题：卵巢颗粒细胞等存在异常，会影响雌激素等的合成与分泌，进而干扰卵泡发育。像多囊卵巢综合征患者，其卵巢局部内分泌环境紊乱，雄激素水平升高，影响卵泡发育，使其生长停滞在小卵泡阶段，这类患者往往有月经不调等表现，且多为育龄女性。
遗传因素
染色体异常：某些染色体数目或结构的异常可影响卵泡发育。例如特纳综合征（45，X0），患者性染色体异常，卵巢发育不良，卵泡数量少且多为小卵泡，这类患者从儿童期开始就可能出现生长发育迟缓等表现，属于先天性遗传因素导致。
生活方式因素
过度节食：长期过度节食会使机体营养摄入不足，影响激素合成原料，导致内分泌紊乱，进而影响卵泡发育。比如一些为追求身材过度节食的年轻女性，可能出现卵泡小的情况，这类人群多为关注身材、有过度节食减肥经历的女性。
长期精神压力过大：长期精神压力过大可通过影响神经内分泌系统，导致下丘脑-垂体-卵巢轴功能失调，影响卵泡发育。例如一些工作压力大、长期处于紧张焦虑状态的职场女性，长期精神紧张可能影响卵泡正常生长，这类人群常见于工作节奏快、精神高度紧张的职场女性群体。
疾病因素
甲状腺疾病：甲状腺功能减退或亢进都会影响卵泡发育。甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌减少，会干扰下丘脑-垂体-卵巢轴的功能；甲状腺功能亢进时，甲状腺激素过多也会影响内分泌平衡，进而影响卵泡生长。有甲状腺疾病病史的人群，如曾诊断为甲状腺功能减退症的女性，就可能出现卵泡小的情况。
高泌乳素血症：血清泌乳素水平升高会抑制FSH的分泌，从而影响卵泡发育。垂体微腺瘤等疾病可导致高泌乳素血症，这类患者可能出现月经紊乱、泌乳等表现，同时伴有卵泡小的情况，常见于有垂体微腺瘤等相关疾病的女性。
