肺真菌感染可引发呼吸系统相关症状，如咳嗽（早期多为刺激性干咳或伴少量白痰，不同人群表现有差异）、发热（部分患者出现，免疫状况不同发热表现不同）、呼吸困难（病情进展出现，不同人群早期表现有别）；还有全身症状，如乏力（机体应对感染消耗能量等致，不同年龄人群表现不同）、消瘦（未及时控制影响食欲等致，对不同人群影响不同）；部分患者可能伴随胸痛（真菌炎症累及胸膜等致，不同个体敏感程度不同）。
发热：部分患者会出现发热，体温可呈低热（37.3-38℃）或中等度热（38.1-39℃），发热机制是真菌在体内引发免疫反应，导致机体产热增加。免疫功能正常的人群发热可能相对较轻，而免疫功能低下者，如长期使用免疫抑制剂的患者、艾滋病患者等，发热可能更持续且程度可能较高。
呼吸困难：早期呼吸困难症状可能不明显，但随着病情进展可能出现。这是因为肺部组织受到真菌侵犯，影响气体交换功能。老年人由于肺功能本身有所减退，在肺真菌感染早期可能就较易出现活动后气短等轻度呼吸困难表现，而青壮年免疫功能较好时，早期呼吸困难可能不突出。
全身症状
乏力：患者会感觉全身疲倦、没有力气，这是因为机体在应对真菌感染的过程中，消耗大量能量，且炎症反应会导致身体处于应激状态。不同年龄人群乏力表现程度可能不同，儿童可能表现为活动耐力下降，不愿意玩耍等；老年人则可能表现为日常活动受限，如原本能快速上下楼，现在爬几层楼就感觉乏力。
消瘦：如果肺真菌感染未能及时控制，可能会影响患者的食欲，导致摄入减少，同时机体代谢增加，从而出现消瘦情况。对于儿童来说，会影响其生长发育；对于老年人，可能会进一步降低身体抵抗力，加重病情。
其他可能伴随症状
胸痛：少数患者可能出现胸痛，多为隐痛或钝痛，是由于真菌炎症累及胸膜等组织引起。不同个体对疼痛的敏感程度不同，有些患者可能胸痛症状较明显，而有些患者可能症状较轻，容易被忽视。例如，有基础肺部疾病的患者，可能原本就有胸痛相关的基础情况，对于肺真菌感染引起的胸痛可能不易早期识别。
