甲亢不治疗会带来多方面危害，包括心血管系统损害致心动过速、心脏扩大等，代谢紊乱致能量和蛋白质代谢异常、影响生长发育与月经等，骨骼系统致骨密度降低、易骨折，神经系统致神经兴奋性增高及精神心理问题，还可致眼部病变、免疫系统紊乱等，不同年龄人群受影响程度和表现有所不同。
代谢紊乱相关危害
能量代谢紊乱：甲状腺激素过多会加速机体的新陈代谢，患者会出现消瘦、乏力等症状，即使进食量增加，也难以维持正常体重，体重可能会在短期内明显下降。对于儿童患者，会影响其生长发育，导致身高增长缓慢、体重不增等情况；对于女性患者，可能会影响月经周期，出现月经稀少甚至闭经等问题。
蛋白质代谢紊乱：过多的甲状腺激素会使蛋白质分解加速，导致患者出现负氮平衡，肌肉逐渐萎缩，尤其是近端肌肉，表现为肢体无力，影响日常活动能力。老年人本身肌肉量相对较少，甲亢不治疗导致的蛋白质代谢紊乱会使肌肉萎缩情况更为突出，进一步影响其生活自理能力。
骨骼系统影响
甲亢不治疗会引起骨代谢异常，导致骨密度降低，增加骨质疏松的发生风险。患者可能会出现骨痛，尤其是腰背部疼痛较为常见。长期的骨质疏松会使骨骼脆性增加，容易发生骨折，即使是轻微的外力作用也可能导致骨折，如椎体压缩性骨折等。对于绝经后的女性甲亢患者，本身就处于骨质疏松的高危阶段，甲亢不治疗会进一步加重骨质疏松的程度；儿童患者骨骼还在发育阶段，甲亢导致的骨代谢异常会影响骨骼的正常生长和发育，可能导致骨骼畸形等问题。
神经系统影响
患者会出现神经兴奋性增高的表现，如烦躁不安、易激动、失眠等。严重时可能会出现焦虑症、抑郁症等精神心理问题。对于儿童患者，神经系统尚未完全发育成熟，甲亢不治疗引起的神经兴奋性增高可能会影响其学习和行为表现，导致注意力不集中、情绪不稳定等情况；老年人由于神经系统功能本身有所减退，甲亢不治疗导致的神经精神症状可能会对其认知功能和生活质量产生更为明显的不良影响，如出现记忆力减退、反应迟钝等。
其他危害
眼部病变：部分甲亢患者会出现眼部病变，如浸润性突眼，表现为眼球突出、眼裂增宽、眼部肿痛、流泪、视力下降等。严重的浸润性突眼可能会导致角膜溃疡、失明等严重后果。不同年龄的患者眼部病变的表现可能有所不同，儿童患者眼部病变相对较少见，但一旦发生也需要引起重视；老年患者眼部病变恢复相对较慢，且可能会合并其他眼部疾病，增加治疗的难度。
免疫系统紊乱：甲亢属于自身免疫性疾病，不治疗时免疫系统持续处于异常活跃状态，可能会导致其他自身免疫性疾病的发生风险增加，如类风湿关节炎等。对于有自身免疫性疾病家族史的患者，甲亢不治疗会进一步加大患其他自身免疫性疾病的可能性，需要密切关注自身免疫状态的变化。
