畸胎瘤成因未完全明确，相关因素有生殖细胞异常（胚胎期分化异常、异位种植）、遗传因素（遗传性综合征相关、家族遗传倾向）、环境因素（孕期不良环境暴露、生活方式相关因素），不同人群患畸胎瘤情况不同，有家族遗传倾向人群需密切关注自身状况定期检查。
生殖细胞异常
胚胎期生殖细胞分化异常：在胚胎发育早期，生殖细胞的分化出现异常情况。正常情况下生殖细胞会按照特定的路径发育，但如果在这个过程中受到某些因素干扰，就可能导致生殖细胞异常分化，进而形成畸胎瘤。例如，在胚胎发育的关键阶段，受到遗传因素或者环境中某些不良因素影响时，原始生殖细胞分化偏离正常轨道，逐渐发展成具有多种组织成分的畸胎瘤。
生殖细胞异位种植：部分生殖细胞可能会异位种植到身体的其他部位，然后在这些异位的部位增殖分化形成畸胎瘤。比如，有些生殖细胞可能种植到卵巢、睾丸等原本不是其正常所在但又具备一定微环境适合其生长的部位，从而逐渐发展成畸胎瘤。
遗传因素
某些遗传性综合征相关：一些遗传性综合征与畸胎瘤的发生有关联。例如，皮-杰综合征（Peutz-Jegherssyndrome）等遗传性疾病，患者发生畸胎瘤的风险可能会增加。这些遗传性综合征往往存在特定的基因异常，使得机体更容易出现细胞的异常增殖分化，进而引发畸胎瘤等相关肿瘤性病变。
家族遗传倾向：如果家族中有亲属患有畸胎瘤，那么个体发生畸胎瘤的风险可能相对较高。虽然具体的遗传方式还不是完全清晰，但家族遗传因素在畸胎瘤的发生中起到一定作用。可能是家族中存在某些与畸胎瘤发生相关的易感基因，使得携带这些基因的个体更容易受到各种内外因素影响而发生畸胎瘤。
环境因素
孕期不良环境暴露：母亲在孕期如果暴露于某些不良环境中，可能会增加胎儿患畸胎瘤的风险。比如孕期接触某些化学物质，像一些工业污染物、农药等，这些化学物质可能会干扰胎儿的正常发育过程，影响生殖细胞的分化等，从而增加畸胎瘤发生的可能性；孕期受到辐射照射，无论是医疗辐射还是环境中的辐射，都可能对胎儿的细胞造成损伤，导致细胞异常增殖分化，引发畸胎瘤。
生活方式相关因素：长期的不良生活方式也可能有一定影响。例如长期吸烟、酗酒的女性，其身体内环境可能发生改变，影响生殖系统的正常功能，使得生殖细胞更容易出现异常，增加畸胎瘤发生几率；长期处于精神压力过大状态下，可能会影响内分泌系统的平衡，进而间接影响生殖细胞的正常发育，增加畸胎瘤的发病风险。
不同年龄段、性别等人群患畸胎瘤的具体情况有所不同。对于女性来说，卵巢是畸胎瘤常见的发生部位，在青春期、育龄期等不同阶段都可能发生；男性的睾丸也是畸胎瘤的好发部位之一。儿童时期如果出现生殖细胞相关异常等情况也可能导致畸胎瘤发生。而对于有家族遗传倾向的人群，更需要密切关注自身身体状况，定期进行相关检查，以便早期发现、早期处理畸胎瘤相关问题。
