肾结石的症状包括疼痛（肾区或腰腹部隐痛、胀痛或剧烈绞痛，可放射，部分有腹痛）、血尿（肉眼或镜下血尿）、排尿异常（尿频、尿急、尿痛，较大结石或下段结石致排尿困难）及其他症状（肾绞痛时恶心、呕吐，合并严重感染时发热、寒战）。
肾区疼痛：多数患者会出现肾区或腰腹部的疼痛，疼痛性质多样，可为隐痛、胀痛或剧烈绞痛。绞痛常突然发作，疼痛程度较为剧烈，如刀割样，可放射至下腹部、腹股沟、大腿内侧等部位。这是因为结石在肾盂或输尿管内移动，刺激输尿管平滑肌，引起痉挛所致。例如，有研究表明，约75%的肾结石患者会出现肾绞痛症状，疼痛发作时患者往往难以忍受，常辗转不安。
腹痛：部分患者可能表现为腹痛，尤其是结石向下移动时，可能引起下腹部的牵涉痛，容易被误诊为其他腹部疾病。
血尿
肉眼血尿或镜下血尿：结石活动时会损伤肾盂、输尿管黏膜，导致黏膜出血，从而出现血尿。血尿可为肉眼可见的粉红色、红色尿液，也可能仅通过显微镜检查发现尿液中有红细胞。一般来说，镜下血尿更为常见，约半数以上肾结石患者会出现不同程度的血尿。例如，在临床观察中，很多肾结石患者就诊时通过尿常规检查可发现镜下血尿。
排尿异常
尿频、尿急、尿痛：如果结石合并尿路感染，或者结石刺激膀胱，患者可能出现尿频、尿急、尿痛的症状。尿频是指排尿次数增多，尿急是指突然产生强烈的排尿欲望且难以控制，尿痛是指排尿时尿道或会阴部产生疼痛。这是因为炎症刺激膀胱和尿道黏膜，导致其敏感性增高。
排尿困难：较大的肾结石或结石位于输尿管下段时，可能阻塞尿路，导致排尿困难，表现为尿流变细、排尿费力等。
其他症状
恶心、呕吐：肾绞痛发作时，疼痛可刺激神经反射，引起胃肠道反应，导致患者出现恶心、呕吐症状，且呕吐后疼痛症状往往无明显缓解。这是由于内脏神经与胃肠道神经存在关联，疼痛信号传导可影响胃肠道功能。
发热、寒战：当肾结石合并严重尿路感染时，患者可能出现发热、寒战等全身感染症状，体温可升高至38℃以上，这是因为细菌感染扩散，引起全身炎症反应。例如，有研究显示，约10%-15%的肾结石患者合并感染时会出现发热等全身症状。
