肠结核由结核分枝杆菌引起，症状因病情等不同有差异，消化道症状有右下腹隐痛钝痛、腹泻便秘（溃疡型腹泻，增生型便秘）、增生型有腹部肿块；全身症状有溃疡型午后低热伴盗汗等、长期有营养不良；部分患者有肠外结核表现如肺结核症状
消化道症状：
腹痛：多位于右下腹，因肠结核好发于回盲部。疼痛性质一般为隐痛或钝痛，有时在进餐时诱发，与回盲部病变引起的肠反射性痉挛有关。进食可引起胃结肠反射或胃回肠反射，使疼痛加重，便后可稍有缓解。如果是增生型肠结核，腹痛症状相对较轻，可呈间歇性发作；而溃疡型肠结核腹痛较为明显，可伴有腹胀等表现。不同年龄人群中，儿童肠结核腹痛可能表现相对不典型，可能为脐周或全腹疼痛；老年人肠结核腹痛表现也可能不典型，需仔细鉴别。
腹泻与便秘：溃疡型肠结核常伴有腹泻，大便呈糊样或水样，一般无脓血，每日数次至十余次。这是因为溃疡型肠结核病变肠段的炎症和溃疡使肠蠕动加快，排空加速，影响水分吸收所致。而增生型肠结核多以便秘为主要表现，这是由于病变部位肠腔狭窄，肠内容物通过受阻。在生活方式方面，长期熬夜、过度劳累等可能影响机体免疫力，使肠结核患者的腹泻或便秘症状可能加重；有基础胃肠道疾病病史的人群，患肠结核时消化道症状可能更复杂。
腹部肿块：多见于增生型肠结核，常位于右下腹，质地中等、较固定、伴有轻至中度压痛。这是因为增生型肠结核主要表现为肠壁大量结核肉芽肿和纤维组织增生，使肠壁增厚形成肿块。
全身症状：
发热：溃疡型肠结核常有结核毒血症，表现为午后低热，部分患者可伴有盗汗、乏力、消瘦等全身症状，这是由于结核分枝杆菌感染后引起的全身性炎症反应。儿童肠结核患者全身症状可能相对更明显，如发热持续时间较长、消瘦更为显著等，因为儿童处于生长发育阶段，感染结核分枝杆菌后对全身状况影响较大；老年人肠结核患者全身症状可能相对隐匿，发热程度可能较低，消瘦表现也可能不突出，但往往提示病情可能较为隐匿，需要更细致检查。
营养不良：长期的消化道症状及结核毒素的影响，患者可出现营养不良，表现为贫血、低蛋白血症等，儿童患者可能影响生长发育，出现身高、体重低于同龄人标准；老年人则可能进一步加重机体衰弱，增加其他并发症发生风险。
肠外结核表现：部分患者可同时伴有肺结核等肠外结核的表现，如咳嗽、咳痰、咯血等肺结核相关症状。
