咖啡灌肠对身体有诸多伤害，包括肠道损伤如肠黏膜损伤、肠道菌群失调；电解质紊乱如钠钾等电解质失衡；感染风险如肠道感染及其他部位感染风险，不同人群受影响程度不同，老年人、儿童、免疫功能低下及有基础疾病人群受影响更甚。
肠黏膜损伤：咖啡灌肠时，咖啡溶液需通过直肠进入结肠，咖啡中的某些成分可能对肠黏膜产生刺激。正常情况下，肠黏膜有其自身的保护屏障，而咖啡灌肠可能破坏这种屏障。例如，有研究表明，频繁或不恰当的咖啡灌肠可能导致肠黏膜的炎症反应，长期如此可能引发肠黏膜的糜烂、溃疡等情况。对于不同年龄人群，儿童由于肠道黏膜更为娇嫩，更容易受到损伤；成年人若频繁进行咖啡灌肠，也会增加肠黏膜损伤的风险。
肠道菌群失调：肠道内有大量对人体有益的菌群，它们在维持肠道正常生理功能方面起着重要作用。咖啡灌肠可能会打乱肠道菌群的平衡。比如，咖啡中的某些物质可能会抑制有益菌群的生长，而促进有害菌群的繁殖。老年人肠道功能相对较弱，本身肠道菌群的稳定性就较差，进行咖啡灌肠更容易导致肠道菌群失调，进而出现腹泻、便秘等肠道功能紊乱的情况；年轻人群如果不恰当进行咖啡灌肠，也可能影响肠道菌群的正常状态。
电解质紊乱方面
钠钾等电解质失衡：直肠灌肠时，溶液的吸收可能影响体内电解质平衡。咖啡灌肠若导致大量液体进入肠道并被吸收，可能会引起钠、钾等电解质的失衡。例如，大量液体的吸收可能稀释血液中的电解质浓度，导致低钠血症或低钾血症等。对于患有基础疾病如心脏病、肾脏疾病的人群，电解质紊乱可能会加重病情。老年人本身各器官功能有所衰退，对电解质变化的调节能力下降，更容易受到咖啡灌肠导致的电解质紊乱影响；患有肾脏疾病的人群，其肾脏对电解质的调节功能本就存在问题，咖啡灌肠更易引发严重的电解质失衡。
感染风险方面
肠道感染：如果咖啡灌肠所使用的器具未严格消毒，或者灌肠环境不卫生，就会增加肠道感染的风险。细菌、病毒等病原体可能通过不清洁的灌肠过程进入肠道，引发肠道炎症。儿童的免疫系统相对较弱，肠道感染的后果可能更为严重，如出现发热、腹痛、腹泻等症状且恢复相对较慢；免疫功能低下的人群，如艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的人群，感染的风险更高，一旦感染可能病情较为复杂，难以控制。
其他部位感染风险：不规范的咖啡灌肠操作还可能导致病原体进入血液等其他部位，引发菌血症等更严重的感染情况。对于有血管疾病、免疫系统严重受损等情况的人群，这种感染风险带来的危害更大，可能会导致全身性的感染炎症反应，影响多个器官的功能。
