出现消化道相关症状如持续便血、长期腹痛腹泻原因不明、大便习惯改变时，以及大肠癌高危人群、钡剂灌肠等检查发现异常、腹部不适怀疑肠道疾病但其他检查难明确时，需进行肠镜检查，其可明确肠道内情况、排查肠道病变等以制定后续治疗方案等。
一、出现消化道相关症状时
持续便血：无论是黑便还是便中带鲜血，若原因不明且持续存在，可能提示肠道存在病变，如肠道肿瘤、炎症性肠病等，需要通过肠镜检查来明确肠道内的情况。例如，长期患有溃疡性结肠炎的患者，出现便血症状加重时，需进行肠镜检查以评估病情变化及肠道黏膜损伤程度。
长期腹痛、腹泻且原因不明：如果患者长期遭受腹痛、腹泻的困扰，经过常规检查仍不能明确病因，肠镜检查可以直接观察肠道黏膜是否存在炎症、溃疡、息肉等病变。比如一些肠易激综合征患者经过初步检查无法确诊，肠镜检查可排除肠道器质性病变。对于老年患者，长期腹痛、腹泻更需警惕肠道肿瘤等严重疾病，肠镜检查是重要的排查手段。
大便习惯改变：包括大便次数突然增多或减少、腹泻与便秘交替出现等情况。例如原本排便规律的人突然出现腹泻，且持续时间较长，或出现便秘与腹泻交替，可能是肠道功能紊乱或肠道占位性病变引起，肠镜检查有助于查找原因。
二、筛查肠道疾病时
大肠癌高危人群：
年龄因素：45岁以上的人群属于大肠癌的一般高危人群，应定期进行肠镜筛查。随着年龄增长，肠道发生病变的概率增加，45岁后肠道黏膜的各种潜在问题可能逐渐显现。
家族史：如果家族中有大肠癌患者，尤其是一级亲属（父母、子女以及兄弟姐妹）患有大肠癌，那么本人患大肠癌的风险会明显升高，这类人群需要更早且更频繁地进行肠镜检查。比如家族中有直系亲属患结肠癌，建议从比家族中最早发病者的年龄小10岁左右开始进行肠镜筛查。
肠道疾病史：患有溃疡性结肠炎、克罗恩病等慢性肠道炎症性疾病的患者，由于肠道长期处于炎症状态，癌变风险较高，需要定期进行肠镜检查来监测肠道黏膜情况，以及早发现癌变迹象。
生活方式因素：长期高脂、低纤维饮食，缺乏运动，吸烟、酗酒等不良生活方式的人群，也是大肠癌的高危人群，需要通过肠镜检查来筛查肠道健康状况。
三、其他情况
钡剂灌肠等检查发现异常：当患者进行钡剂灌肠X线检查等发现肠道有异常病变，如息肉、可疑肿块等情况时，需要进一步通过肠镜检查来明确病变的性质、部位等，以便制定后续的治疗方案。例如钡剂灌肠发现肠道有息肉样病变，需要肠镜下取组织进行病理检查以确定息肉是良性还是恶性。
腹部不适怀疑肠道疾病但其他检查难以明确：患者有腹部不适的症状，但通过常规的血液检查、腹部超声等检查无法明确病因，怀疑肠道方面的问题时，肠镜检查可以直接观察肠道内部情况，有助于明确是否存在肠道病变导致的腹部不适。
