早上醒来眼睛肿可由生理性、病理性及其他因素引起。生理性因素包括睡眠姿势、时间质量及夜间大量饮水；病理性因素有眼部疾病如结膜炎、睑腺炎，全身系统性疾病如肾脏疾病、甲状腺功能减退症；其他因素为接触过敏原致眼部过敏反应。
一、生理性因素
（一）睡眠相关因素
1.睡眠姿势
夜间睡眠时，如果长时间趴着睡或者枕头过低，会影响面部血液回流，导致眼部组织液积聚，从而引起早上醒来眼睛肿。例如，趴着睡时，脸部受压，阻碍了眼部周围静脉血液和淋巴液的正常回流，使得水分在眼部组织间隙潴留。对于不同年龄段的人群，儿童如果趴着睡，由于其身体各部分发育尚未完全成熟，眼部血液循环调节能力相对较弱，更容易出现眼睛肿的情况；成年人长期保持不良睡眠姿势也会增加眼睛肿的发生几率。
2.睡眠时间与质量
睡眠时间过长或过短都可能导致眼睛肿。一般来说，成年人每晚需要7-9小时的睡眠，如果睡眠时间不足7小时，身体的新陈代谢会受到一定影响，眼部的淋巴循环可能不能正常代谢眼部的多余液体；而睡眠时间过长，比如超过10小时，眼部周围的血液循环可能变得缓慢，也会引起眼睛肿。对于儿童，睡眠时间会因年龄不同而有所差异，婴幼儿睡眠时间较长，一般在12-16小时，若睡眠质量不佳，如频繁夜醒等，也可能出现早上眼睛肿的情况。另外，睡眠质量差，比如多梦等，会影响身体的整体恢复，包括眼部的血液循环和淋巴循环，进而导致眼睛肿。
（二）液体摄入因素
夜间临睡前大量饮水，水分不能及时代谢出去，会潴留于眼部组织中，导致早上眼睛肿。对于不同人群，老年人的肾脏功能有所减退，对水分的代谢能力下降，夜间饮水后更容易出现眼睛肿；孕妇在孕期由于身体负担加重，肾脏对水分的调节功能可能发生变化，若睡前饮水较多，也较易出现早上眼睛肿的情况；儿童如果睡前喝太多水，也可能出现这种现象，因为儿童的肾脏发育尚未完全成熟，对水分的处理能力相对较弱。
二、病理性因素
（一）眼部疾病
1.结膜炎
各种类型的结膜炎，如细菌性结膜炎、病毒性结膜炎等，炎症刺激会导致眼部组织水肿、充血。细菌性结膜炎通常是由于细菌感染引起，患者除了眼睛肿外，还可能伴有眼部分泌物增多、眼睛发红等症状；病毒性结膜炎多由病毒感染所致，具有一定的传染性，除眼睛肿外，常伴有眼睛异物感、流泪等表现。不同年龄段人群均可患病，儿童由于卫生习惯相对较差，更容易感染细菌性结膜炎；成年人如果接触到病毒等病原体也容易患病毒性结膜炎等。
2.睑腺炎
睑腺炎是眼睑腺体的急性化脓性炎症，分为内睑腺炎和外睑腺炎。患病时，眼睑局部会出现红肿、疼痛等症状，早上醒来眼睛肿可能是其中一个表现。儿童由于眼部卫生容易受到忽视，比如用手揉眼睛等，较易患睑腺炎；成年人如果长期熬夜、眼部卫生不佳等也容易发病。
（二）全身系统性疾病
1.肾脏疾病
肾炎等肾脏疾病会导致肾功能异常，使得体内水钠潴留，进而引起眼部水肿，早上醒来眼睛肿是常见表现之一。肾脏疾病引起的水肿往往是从眼睑等组织疏松的部位开始。对于不同年龄段，儿童患肾炎等肾脏疾病可能与感染等因素有关，比如链球菌感染后可能引发急性肾小球肾炎，出现眼睛肿等症状；成年人肾脏疾病的原因较多，如高血压肾病、糖尿病肾病等早期也可能表现为眼部水肿等。
2.甲状腺功能减退症
甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌减少，机体代谢率降低，导致黏液性水肿，眼部也可能出现水肿，表现为早上醒来眼睛肿。这种情况在各个年龄段都可能发生，儿童患先天性甲状腺功能减退症时，除了眼睛肿外，还可能伴有生长发育迟缓、智力低下等表现；成年人患甲状腺功能减退症则可能出现乏力、怕冷、记忆力减退等全身症状，同时伴有眼睛肿。
三、其他因素
（一）过敏因素
接触过敏原，如花粉、尘螨、化妆品等，可引起眼部过敏反应，导致眼睛肿，还常伴有眼睛瘙痒等症状。不同人群对过敏原的接触情况不同，过敏体质的儿童可能更容易接触到花粉等过敏原而出现眼部过敏；成年人如果接触到新的化妆品等也可能发生过敏反应导致眼睛肿。例如，春季花粉传播季节，过敏体质的儿童在户外接触花粉后，回家可能出现眼睛肿、瘙痒等过敏症状。
