乳房导管内乳头状瘤病因未完全明确，可能与激素水平异常（女性生理期因素及内分泌疾病影响）、导管扩张与阻塞（先天性导管发育异常及后天性导管阻塞）、基因突变有关。
激素水平异常
女性生理期因素：在女性的月经周期中，体内雌激素和孕激素水平会发生变化。例如，在月经前期，雌激素水平相对升高，可能会对乳腺导管上皮产生刺激作用。有研究表明，长期雌激素水平异常升高，会导致乳腺导管上皮过度增生，增加导管内乳头状瘤的发生风险。育龄期女性由于月经周期相对规律但激素波动较为频繁，相比其他人群可能在这方面存在一定的易感性。
内分泌疾病影响：患有某些内分泌疾病的女性，如甲状腺功能减退症等，会影响激素的正常代谢和调节。甲状腺功能减退时，机体内分泌系统的平衡被打破，可能间接导致乳腺导管内激素环境改变，使得乳腺导管上皮容易出现异常增生，进而引发导管内乳头状瘤。
导管扩张与阻塞
先天性导管发育异常：部分女性可能存在先天性的乳腺导管发育异常情况，比如导管迂曲、狭窄等。这种先天性的导管结构异常会导致导管内的分泌物排出不畅，长期淤积在导管内，对导管上皮产生刺激，促使上皮细胞增生，逐渐形成导管内乳头状瘤。婴幼儿及儿童时期一般不会出现该疾病，因为先天性导管发育异常多在生长发育阶段就已存在，但可能在青春期后随着激素水平变化等因素逐渐显现症状。
后天性导管阻塞：乳腺导管受到炎症、外伤等因素影响时，可能会发生阻塞。例如，乳腺导管周围组织的慢性炎症，如乳腺炎反复发作，炎症渗出物可能会堵塞导管；乳房受到外伤后，局部组织修复过程中形成的瘢痕等可能会阻塞导管。导管阻塞后，导管内压力升高，导管上皮在压力刺激下发生增生，从而引发导管内乳头状瘤。中青年女性由于可能经历过一些乳腺相关的炎症或外伤情况，相对更容易出现这种后天性导管阻塞的情况。
基因突变：有研究发现，某些基因突变与乳房导管内乳头状瘤的发生存在一定关联。例如，与细胞生长、分化相关的一些基因发生突变时，可能会导致乳腺导管上皮细胞的生长调控失常，使得细胞异常增殖形成乳头状瘤。不过，目前关于具体是哪些基因突变以及其作用机制还在进一步的研究探索中，不同性别都可能受到基因突变的影响，但在不同年龄段的人群中，基因突变导致发病的概率和具体情况可能有所不同。
