复方左炔诺孕酮片有类早孕反应、阴道不规则流血、月经改变、体重变化、乳房胀痛、头痛等常见副作用，育龄女性计划妊娠需提前停药，肝肾功能不全者慎用，有心血管疾病病史者应避免使用，哺乳期女性一般不建议使用。
阴道不规则流血：部分女性在服药期间会出现阴道不规则流血，又称突破性出血。其发生原因与服药过程中体内激素水平波动有关。一般少量出血时可继续服药，随着服药时间增长会逐渐适应；若出血量较多，类似月经量，就需要考虑停药，如同性伴侣固定、生活较规律且无其他特殊病史的女性出现这种情况时需及时评估处理。
月经改变：可能会出现月经周期缩短，经量减少，少数人还可能出现闭经。对于本身月经周期不规律、有内分泌相关病史的女性影响可能相对更显著，比如患有多囊卵巢综合征的女性使用复方左炔诺孕酮片后月经改变可能会更明显。
体重变化：少数人服药后体重会有所增加，这可能与雌激素引起水钠潴留以及孕激素影响代谢等有关。有肥胖倾向或本身有代谢性疾病病史的人群，体重变化可能更易被察觉。
其他：还可能出现乳房胀痛、头痛等情况。乳房胀痛是因为药物中激素对乳房的影响，头痛可能与药物引起的体内激素变化导致血管舒缩功能改变有关。
特殊人群需注意的情况
育龄女性：一般育龄女性使用复方左炔诺孕酮片出现副作用的情况与普通人群类似，但如果有计划妊娠的打算，应提前停药，让身体有足够时间恢复正常的激素水平，因为药物可能会对受孕及早期胚胎发育有一定潜在影响，有生育计划的女性需特别关注停药后的身体状态调整。
有肝肾功能不全病史者：肝肾功能不全的患者使用复方左炔诺孕酮片可能会加重肝肾功能负担，因为药物需要通过肝肾进行代谢，所以这类人群应慎用，使用前需咨询医生，评估肝肾功能状态对药物代谢的影响程度以及使用该药物可能带来的风险。
有心血管疾病病史者：复方左炔诺孕酮片中的雌激素可能会使凝血因子升高，增加血栓形成的风险，对于有心血管疾病病史，比如有过静脉血栓、动脉血栓病史的人群，使用该药物可能会增加心血管事件复发的风险，这类人群应避免使用复方左炔诺孕酮片，可选择其他更合适的避孕方式。
哺乳期女性：哺乳期女性使用复方左炔诺孕酮片，药物可能会通过乳汁传递给婴儿，对婴儿产生影响，一般不建议哺乳期女性使用该药物，如需避孕可选择其他不影响乳汁分泌及婴儿健康的避孕方法，如使用避孕套等。
