鲍温样丘疹病与尖锐湿疣在临床表现、组织病理检查、病毒检测方面有不同特点，妊娠期和儿童患者的区分需结合各自情况，综合相关表现进行区分。鲍温样丘疹病多发生于中青年，损害为多发性色素性丘疹，组织病理有表皮细胞异形等改变，HPV-DNA检测多为低危型但有少数高危型；尖锐湿疣由HPV感染引起，损害为丘疹增大呈特殊形态，组织病理有乳头瘤样增生等，主要由低危型HPV感染；妊娠期和儿童患者区分需谨慎评估影响。
临床表现方面
鲍温样丘疹病：多发生于中青年，损害为多发性色素性丘疹，直径2-10mm，呈圆形、椭圆形或不规则形，颜色可呈棕红、褐黑或黑色，皮疹可单个或多个，可融合，一般无自觉症状或有轻度瘙痒。好发于外阴、腹股沟及肛周等部位，病程慢性，部分患者可自行消退，但也有少数可发展为浸润癌。例如有研究发现鲍温样丘疹病的皮疹分布具有一定的部位特异性，在外阴等部位较为常见。
尖锐湿疣：主要由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，多见于性活跃的青、中年，损害初起为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起，颜色为红色或污灰色。病变多发生在生殖器及肛门周围等部位，常伴有瘙痒、灼痛或性交后出血等症状，且容易复发。
组织病理检查方面
鲍温样丘疹病：组织病理表现为表皮细胞排列紊乱，有异形性，可见角化不良细胞及核分裂象，但一般无角化不全。表皮基底膜完整，真皮上部有慢性炎症细胞浸润。例如通过对鲍温样丘疹病患者皮损进行组织病理切片观察，可清晰看到上述细胞形态学改变。
尖锐湿疣：组织病理主要表现为表皮乳头瘤样增生，棘层肥厚，有挖空细胞，真皮浅层毛细血管扩张，周围有慢性炎症细胞浸润。挖空细胞是尖锐湿疣的特征性细胞，其胞质空泡化，核大居中，有双核或多核等改变。
病毒检测方面
鲍温样丘疹病：一般HPV-DNA检测多为低危型HPV感染，但也有少数高危型HPV感染的情况。例如部分研究显示鲍温样丘疹病中存在HPV16、18等高危型别感染，但相对尖锐湿疣来说，高危型别感染比例可能有所不同。
尖锐湿疣：主要由低危型HPV，如HPV6、11等感染引起，但也有少数高危型HPV感染的病例。通过PCR等病毒检测技术可检测到相应的HPV-DNA。
特殊人群方面，对于妊娠期女性，鲍温样丘疹病和尖锐湿疣的区分同样遵循上述临床表现、组织病理及病毒检测等方法，但需要更加谨慎地考虑妊娠对检查和治疗的影响。妊娠期尖锐湿疣由于激素水平变化等因素，可能生长更迅速，而鲍温样丘疹病在妊娠期的表现也可能有所不同，在诊断和处理时要充分评估对妊娠和胎儿的影响，选择合适的检查和处理方式。对于儿童患者，鲍温样丘疹病和尖锐湿疣相对较少见，但如果发生在外阴等部位，也需要通过详细的病史询问、临床表现观察及必要的检查来进行区分，儿童患者的发病可能与接触感染等因素有关，要注意排除非性传播途径感染的可能。
