咽喉尖锐湿疣与咽炎在症状表现、检查方法、发病原因上有区别。咽喉尖锐湿疣有不洁性接触史，咽喉现丘疹等，由HPV感染性接触传播；咽炎分急慢性，急性起病急有咽痛等，慢性有咽部不适等，急性多由病毒细菌感染等致，慢性常因急性反复等致。
症状表现方面
咽喉尖锐湿疣：多有不洁性接触史，病变主要发生在咽喉部黏膜，通常表现为单个或多个淡红色小丘疹，逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状外观，一般无明显疼痛，但可能会有异物感，若疣体较大堵塞咽喉，还可能出现呼吸困难等症状。不同年龄、性别人群均可发病，生活中不注意安全性行为的人群风险较高。
咽炎：分为急性咽炎和慢性咽炎。急性咽炎起病较急，常表现为咽部干燥、灼热、粗糙感，继而有明显咽痛，吞咽时加重，疼痛可放射至耳部，可伴有发热、头痛、食欲减退等全身症状；慢性咽炎则症状相对持续且较轻，主要有咽部不适感，如异物感、灼热感、干燥感、痒感等，常有刺激性咳嗽，伴恶心，一般无明显的新生物样改变，各年龄段人群均可能患病，生活中用嗓过度、长期处于污染环境等人群易患。
检查方法方面
咽喉尖锐湿疣：医生会进行详细的体格检查，直接观察咽喉部的病变情况，必要时会进行醋酸白试验，若病变处涂抹醋酸后变白，有助于辅助诊断，还可通过病理活检来确诊，病理检查可见特征性的乳头瘤样增生等改变，不同年龄、性别患者的检查操作规范一致，但需注意儿童患者检查时的安抚等人文关怀。
咽炎：医生主要通过体格检查查看咽部黏膜情况，急性咽炎可见咽部黏膜弥漫性充血、肿胀，咽后壁淋巴滤泡增生等；慢性咽炎可见咽部黏膜慢性充血，黏膜下结缔组织及淋巴组织增生，咽后壁有较多颗粒状隆起的淋巴滤泡等，一般无需病理活检来确诊，检查过程中需注意对患者的沟通和安抚。
发病原因方面
咽喉尖锐湿疣：是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播，比如有不洁的性行为史，病毒感染咽喉部黏膜后导致病变发生，不同性别和年龄人群都可能因为接触到病毒而发病，有高危性行为的人群风险显著增加。
咽炎：急性咽炎多由病毒感染（如腺病毒、副流感病毒等）、细菌感染（如A组乙型溶血性链球菌等）引起，受凉、疲劳、长期受化学气体或粉尘等刺激易诱发；慢性咽炎常为急性咽炎反复发作所致，另外，鼻腔、鼻窦的慢性炎症，长期张口呼吸，烟酒过度，有害气体刺激等都可引发，各年龄、性别人群均可因上述不同因素患病，长期处于不良环境或有反复上呼吸道感染病史的人群更易发病。
