生殖器疱疹与尖锐湿疣在临床表现、实验室检查及发病部位分布有差异。临床表现上，生殖器疱疹初发有烧灼感、红斑、群集小水疱等，易复发，不同人群表现有别；尖锐湿疣是生殖器等部位赘生物，初为小丘疹，渐增大，一般无症状，易复发。实验室检查中，病毒学检查生殖器疱疹有涂片、培养、核酸检测等方法，尖锐湿疣有醋酸白试验、病理检查；血清学检查生殖器疱疹可查抗体，尖锐湿疣无特异性血清学检查。发病部位分布上，生殖器疱疹好发于生殖器及肛周，单侧或双侧对称分布；尖锐湿疣好发部位类似，赘生物多发，散在或融合，无严格单侧双侧区分，常簇集分布
临床表现差异
生殖器疱疹：初发时局部多有烧灼感、红斑，随后出现群集性小水疱，可为粟粒至绿豆大小，疱液初始清亮，后可浑浊化脓，破溃后形成糜烂或浅溃疡，有疼痛感，常伴有腹股沟淋巴结肿痛、发热、头痛等全身症状，病程一般2-3周，易复发。不同人群表现可能有差异，如孕妇感染生殖器疱疹可能增加早产、胎儿感染等风险；免疫功能低下者症状可能更重、持续时间更长。
尖锐湿疣：主要表现为生殖器、肛门周围等部位的赘生物，初期为单个或多个淡红色小丘疹，质地柔软，逐渐增多增大，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等，一般无明显自觉症状，少数患者可有异物感、灼痛、瘙痒或性交不适，病程不定，部分可自行消退，但易复发。不同年龄、性别的患者，其好发部位可能略有不同，如女性好发于大小阴唇、阴道口、会阴等部位，男性好发于龟头、冠状沟、包皮系带等部位。
实验室检查鉴别
病毒学检查
生殖器疱疹：可采用涂片法，取皮损处疱液涂片，行吉姆萨染色或Papanicolaou染色，可发现多核巨细胞和核内嗜酸性包涵体，但敏感性较低；也可进行病毒培养，将皮损处标本接种于特定细胞培养物中，若能分离出单纯疱疹病毒则可确诊，其特异性高，但操作复杂、耗时较长；还可采用核酸检测技术，如聚合酶链反应（PCR）等，能快速、敏感地检测出单纯疱疹病毒的核酸，对早期、症状不典型的患者诊断价值高。
尖锐湿疣：常用醋酸白试验，用3%-5%醋酸溶液涂抹或湿敷患处，若病变部位变白则为阳性，可辅助诊断，但有假阳性可能；病理检查是诊断尖锐湿疣的金标准，取病变组织进行病理切片，可见表皮角化过度或角化不全，棘层肥厚，乳头瘤样增生，表皮突增粗延长，真皮浅层毛细血管扩张，周围有慢性炎细胞浸润等特征性改变。
血清学检查
生殖器疱疹：可检测单纯疱疹病毒抗体，如IgG、IgM抗体等。IgM抗体阳性提示近期感染，IgG抗体阳性表示既往感染或现症感染，但单纯血清学检查不能区分是初发还是复发感染，且可能存在假阳性或假阴性情况，需结合临床表现等综合判断。
尖锐湿疣：一般无特异性血清学检查，主要依靠临床表现和病理检查等进行诊断。
发病部位及分布特点
生殖器疱疹：好发于生殖器及肛周部位，男性多见于龟头、冠状沟、阴茎体、尿道口等，女性多见于大小阴唇、阴蒂、宫颈、阴道等，也可发生于臀部、股部等部位，通常为单侧分布或双侧对称分布。
尖锐湿疣：好发部位与生殖器疱疹类似，但赘生物多为多发，可散在分布或融合成大片，一般无明显单侧或双侧分布的严格区分，常呈簇状或群集分布。
