妊娠合并尖锐湿疣与多种因素相关，人乳头瘤病毒（HPV）感染是主要病因，低危型HPV如HPV6型、11型等相关，妊娠期激素变化、免疫抑制致易感性增加；性行为是重要传播途径相关因素，性伴侣感染、初次性行为年龄小及性伴侣数量多会增加感染风险；机体免疫状态影响发病，妊娠期免疫功能特点及既往免疫相关疾病或治疗会降低免疫抵御力；局部环境因素起作用，生殖道局部潮湿环境利于HPV存活繁殖，分娩时胎儿可能接触产道HPV致新生儿患病。
人乳头瘤病毒（HPV）感染是妊娠合并尖锐湿疣的主要病因
HPV是一种双链环状DNA病毒，有多种亚型。其中，低危型HPV，如HPV6型、11型等与尖锐湿疣的发生密切相关。妊娠期女性由于体内激素水平的变化，如雌激素水平升高，会使阴道上皮糖原增加，酸度增高，有利于HPV的生长繁殖；同时，妊娠期女性的免疫系统会受到一定程度的抑制，机体对HPV的清除能力下降，这都增加了HPV感染的易感性，从而容易引发尖锐湿疣。
性行为是重要的传播途径相关因素
性伴侣感染：如果性伴侣感染了低危型HPV，在无保护措施的性行为过程中，妊娠期女性很容易被传染。因为HPV可以通过性接触直接传播，病毒可通过皮肤或黏膜的微小破损进入上皮细胞内复制、增殖，导致上皮细胞异常分化和增生，引起尖锐湿疣病变。
初次性行为年龄小及性伴侣数量多：研究表明，初次性行为年龄小于16岁以及性伴侣数量多于10个的妊娠期女性，感染HPV的风险显著增加。这是因为年轻女性的生殖系统尚未完全发育成熟，局部抵抗力相对较弱，而多个性伴侣会大大增加接触HPV的机会。
机体免疫状态影响发病
妊娠期免疫功能特点：妊娠期女性的免疫系统处于一种相对特殊的状态，母体为了维持妊娠，对免疫系统进行了一定程度的调整，以避免对胎儿产生排斥反应。这种免疫状态的改变使得机体对HPV的监视和清除能力降低。例如，Th1/Th2细胞因子平衡向Th2型偏移，导致细胞免疫功能相对抑制，从而有利于HPV在体内的潜伏和增殖，增加了尖锐湿疣的发病几率。
既往免疫相关疾病或治疗影响：如果妊娠期女性既往患有免疫缺陷性疾病，如艾滋病等，或者曾经接受过免疫抑制治疗，那么其自身的免疫功能会进一步受损，对HPV的抵御能力大幅下降，更容易发生HPV感染并发展为尖锐湿疣。
局部环境因素的作用
生殖道局部环境：妊娠期女性的生殖道局部环境发生改变，阴道分泌物增多，潮湿的环境有利于HPV的存活和繁殖。而且，阴道酸碱度的变化也为HPV的生长提供了适宜的条件。此外，分娩过程中胎儿通过产道时，也可能会接触到产道部位的HPV，从而增加新生儿喉部等部位发生尖锐湿疣的风险。
