尖锐湿疣与扁平湿疣在病原体、皮损表现、好发人群、传播途径及实验室检查等方面存在不同，特殊人群如孕妇患病需特别注意，有不洁性行为史者出现类似皮损应及时就医明确诊断以采取正确措施。
一、病原体不同
尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，其中低危型HPV6、11等型别常见。
扁平湿疣是二期梅毒的一种皮肤表现，病原体是苍白螺旋体（梅毒螺旋体）。
二、皮损表现不同
尖锐湿疣：损害初起为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起。颜色多为红色或污灰色。好发于生殖器和肛周等部位。
扁平湿疣：为扁平的丘疹或斑块，表面糜烂湿润，内含大量梅毒螺旋体。损害通常为多发，可融合成较大的斑块，颜色呈淡红色或灰白色。好发于外生殖器、肛门周围等部位。
三、好发人群不同
尖锐湿疣：多见于性活跃的中青年，有不洁性接触史者易患，免疫力低下者也可能发病。
扁平湿疣：主要见于梅毒患者，有不洁性交史或感染梅毒的病史，梅毒螺旋体感染后经一定潜伏期发病。
四、传播途径不同
尖锐湿疣：主要通过性接触传播，少数可通过间接接触污染的物品（如内裤、浴巾、浴盆等）传播。
扁平湿疣：主要通过性接触传播，也可通过母婴传播，患梅毒的孕妇可通过胎盘传给胎儿，引起先天性梅毒。
五、实验室检查不同
尖锐湿疣：醋酸白试验可呈阳性，病理检查可见表皮乳头瘤样增生，棘层上部和颗粒层可见凹空细胞。通过PCR等分子生物学方法可检测出HPVDNA。
扁平湿疣：暗视野显微镜检查可在皮损处找到苍白螺旋体。血清学检查梅毒螺旋体抗体及非梅毒螺旋体抗体阳性，如梅毒螺旋体颗粒凝集试验（TPPA）、快速血浆反应素环状卡片试验（RPR）等。
对于特殊人群，如孕妇患有尖锐湿疣或扁平湿疣需特别注意。孕妇患尖锐湿疣可能在分娩时传染给新生儿，需谨慎选择治疗方式；孕妇患扁平湿疣则需积极治疗梅毒，以避免母婴传播，治疗时要充分考虑胎儿的安全，选择对胎儿影响小的治疗方案。而对于有不洁性行为史的人群，无论出现哪种类似皮损表现，都应及时就医，进行相关检查以明确诊断，以便采取正确的治疗和预防措施。
