尖锐湿疣主要由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，高危型HPV如HPV6、11型等与之密切相关，HPV喜温暖潮湿环境，经皮肤或黏膜微小破损进入上皮细胞增殖致病变，性行为因素中性活跃、无保护性行为易感染，免疫功能低下者包括患基础疾病及长期用免疫抑制剂者感染风险高，局部环境中潮湿多汗部位及皮肤破损处易增加感染几率
人乳头瘤病毒（HPV）感染
尖锐湿疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，其中高危型HPV，尤其是HPV6、11型等与尖锐湿疣的发生密切相关。HPV病毒喜欢温暖、潮湿的环境，会通过皮肤或黏膜的微小破损进入上皮细胞内，特别是基底层细胞，并在细胞内复制、增殖，导致上皮细胞异常分化和增生，从而引起病变。不同年龄、性别的人群都可能感染HPV，有多个性伴侣、首次性生活年龄小的人群感染风险更高。
性行为因素
性活跃人群：性行为是尖锐湿疣的主要传播途径，性伴侣越多，感染尖锐湿疣的几率越大。年轻的性活跃人群由于性接触较为频繁，且生殖器官处于发育阶段，局部免疫能力相对较弱，更容易受到HPV的侵袭。例如，有研究发现，16-25岁的人群感染相关HPV的概率相对较高。
无保护性行为：不使用安全套等保护措施时，性传播的风险显著增加。因为安全套可以在一定程度上减少皮肤黏膜与含有HPV的体液直接接触的机会，没有保护的性行为使得HPV更易通过性器官的直接接触而传播。
免疫功能低下
基础疾病影响：患有某些基础疾病导致免疫功能低下的人群，如艾滋病患者，由于机体的免疫系统被严重破坏，对HPV的清除能力大幅下降，感染尖锐湿疣的概率远高于免疫功能正常的人群。而且一旦感染，病情往往较为严重，容易反复发作且难以控制。
长期使用免疫抑制剂：长期使用免疫抑制剂的患者，例如器官移植后需要长期服用免疫抑制剂来防止排斥反应的人群，其机体的免疫监视功能受到抑制，对HPV的抵御能力减弱，更容易感染尖锐湿疣，并且病情可能迁延不愈。
局部环境因素
潮湿、多汗部位：生殖器部位如果经常处于潮湿、多汗的环境中，比如长期穿紧身不透气的内裤，会为HPV的生存和繁殖提供有利条件。温暖潮湿的环境有利于HPV病毒在皮肤黏膜上定植和生长，增加了患尖锐湿疣的风险。
局部皮肤破损：生殖器部位如果有外伤、摩擦等导致皮肤黏膜破损，就为HPV的侵入打开了门户。当皮肤黏膜存在破损时，HPV更容易通过破损处进入细胞内引发感染，例如性生活过程中的过度摩擦可能导致局部皮肤黏膜轻微破损，从而增加感染几率。
