珍珠疹与尖锐湿疣在外观表现、生长速度、醋酸白试验及病理检查上有不同特点，珍珠疹一般是白色等小丘疹、生长缓慢、醋酸白试验阴性、病理无HPV感染特征；尖锐湿疣是淡红色丘疹渐增大成赘生物、生长快、醋酸白试验可发白、病理有HPV感染表现，儿童及女性鉴别时各有需注意情况
外观表现
珍珠疹：通常为白色、肤色或淡红色的小丘疹，大小较为一致，直径一般在1-3毫米左右，呈规则的排列，多环绕在阴茎冠状沟处，排列整齐如珍珠状，彼此不融合。常见于青春期后的男性，可能与局部刺激等因素有关，一般无自觉症状。
尖锐湿疣：初期为细小淡红色丘疹，之后逐渐增大增多，可发展为乳头样、菜花状或鸡冠状的赘生物，疣体的大小差异较大，小的可能如针头，大的可呈拳头大小，颜色可为白色、粉红色或污灰色，表面不光滑，触碰易出血，常发生在生殖器及肛周等部位，可伴有瘙痒、疼痛、异物感等症状，且可能会逐渐增多、增大，有传染性，多通过性接触传播。
生长速度
珍珠疹：生长速度较为缓慢，长时间内形态和大小通常不会有明显变化。
尖锐湿疣：生长速度相对较快，疣体可在较短时间内明显增大、增多。
醋酸白试验
珍珠疹：进行醋酸白试验时，一般不会出现发白的现象。因为珍珠疹不是由人类乳头瘤病毒（HPV）感染引起，所以醋酸白试验阴性。
尖锐湿疣：进行醋酸白试验时，病变部位可出现发白现象。这是由于HPV感染后，被感染的细胞产生的角蛋白与醋酸发生反应，导致局部变白，但该试验并非特异性诊断方法，还需结合其他检查综合判断。
病理检查
珍珠疹：病理检查可见正常的组织结构，没有HPV感染的特征性改变，表皮正常或轻度增生，真皮内有轻度炎症细胞浸润等，但无病毒感染相关的细胞病理改变。
尖锐湿疣：病理检查可发现特征性的空泡细胞等HPV感染的病理表现，表皮呈乳头瘤样增生，棘层肥厚，有挖空细胞等，可明确有HPV感染。
特殊人群方面，对于儿童，如果生殖器部位出现类似皮疹，要考虑是否有特殊的感染或发育情况等，需谨慎鉴别，因为儿童出现尖锐湿疣可能与不洁接触等异常情况有关，而珍珠疹在儿童中相对少见。对于女性，鉴别时也需从外观、生长速度等多方面综合判断，同时要注意询问性生活史等情况，因为女性尖锐湿疣也可发生在生殖器等部位，表现可能与男性有一定相似性，但也有其自身特点。
