生殖器疱疹由单纯疱疹病毒（HSV）引起，HSV-2是主要致病病原体，人群普遍易感，不洁性行为、自身免疫力低下易致其发病；尖锐湿疣由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，低危型HPV如HPV6、HPV11等与之密切相关，多见于16-35岁人群，不洁性行为、免疫功能低下易致其发病，二者是由不同病毒引起的不同疾病。
生殖器疱疹与尖锐湿疣不是同一种病毒
生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒（HSV）引起的，单纯疱疹病毒分为单纯疱疹病毒1型（HSV-1）和单纯疱疹病毒2型（HSV-2），其中HSV-2是生殖器疱疹的主要致病病原体。而尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，HPV有多种亚型，其中高危型HPV持续感染与宫颈癌等恶性肿瘤相关，低危型HPV如HPV6、HPV11等与尖锐湿疣的发生密切相关。
单纯疱疹病毒相关情况
年龄与性别：人群普遍易感，不同年龄和性别均可发病，性生活活跃的人群相对更易感染HSV-2型病毒引发生殖器疱疹。
生活方式：不洁性行为是重要的传播途径，若有多个性伴侣等高危性行为方式，感染单纯疱疹病毒的风险会显著增加。
病史影响：自身免疫力低下的人群，如患有艾滋病等免疫缺陷性疾病的患者，更容易反复发生生殖器疱疹且病情可能更严重。
人乳头瘤病毒相关情况
年龄与性别：多见于16-35岁人群，女性相对男性在HPV感染及相关尖锐湿疣发病上可能因生理结构等因素有一定差异，但男性也可患病。
生活方式：同样与不洁性行为密切相关，性生活开始年龄早、多个性伴侣等不良生活方式会增加HPV感染进而患尖锐湿疣的几率。
病史影响：免疫功能低下的人群，如长期使用免疫抑制剂的患者等，感染HPV后发生尖锐湿疣的可能性增大且病情更难控制。
