鲍温样丘疹病与尖锐湿疣在临床表现上，鲍温样丘疹病好发于青壮年，多为多发性扁平丘疹，一般无自觉症状，HPV检测多为阴性或低危型阳性；尖锐湿疣多见于性活跃中青年人，皮损初起为淡红色小丘疹，后增多增大，有异物感等症状，主要由低危型HPV感染引起，HPV检测阳性。病理表现上，鲍温样丘疹病无挖空细胞，尖锐湿疣有挖空细胞。特殊人群中妊娠期女性和儿童的鉴别也依据上述标准，妊娠期需考虑胎儿安全，儿童鲍温样丘疹病罕见，尖锐湿疣有性虐待史等情况需特殊考虑。
临床表现方面
鲍温样丘疹病：好发于青壮年，损害多为多发性扁平丘疹，大小不等，呈肤色、红褐色或黑褐色，一般无自觉症状，部分患者可有瘙痒感。损害可发生于阴茎、阴囊、大小阴唇、肛周等部位。
尖锐湿疣：多见于性活跃的中青年人，皮损初起为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增多增大，可呈乳头状、菜花状、鸡冠状等。好发于生殖器及肛门周围等部位，患者多有异物感、灼痛、刺痒或性交不适等症状。
病理表现方面
鲍温样丘疹病：组织病理表现为表皮细胞排列紊乱，有异形细胞，可见角化不良细胞及核分裂象，但一般无挖空细胞。
尖锐湿疣：组织病理可见表皮呈乳头瘤样增生，棘层肥厚，有挖空细胞，真皮浅层毛细血管扩张，周围有慢性炎细胞浸润。
病毒检测方面
鲍温样丘疹病：一般人乳头瘤病毒（HPV）检测多为阴性或低危型HPV阳性，但与尖锐湿疣的低危型HPV亚型分布可能有差异。
尖锐湿疣：主要由低危型HPV，如HPV6、11型等感染引起，HPV检测可呈阳性。
特殊人群方面，对于妊娠期女性，鲍温样丘疹病和尖锐湿疣的鉴别同样依据上述临床表现、病理及病毒检测等，但妊娠期由于生理变化，尖锐湿疣可能生长加速等，需要更加谨慎评估和处理，要充分考虑胎儿安全等因素，选择对妊娠影响最小的诊断和处理方式；对于儿童，鲍温样丘疹病罕见于儿童，尖锐湿疣若有性虐待史等情况时需特殊考虑，儿童尖锐湿疣多考虑通过间接接触等感染，但诊断鉴别仍遵循上述临床、病理等标准，要注意保护儿童隐私等人文关怀方面。
