黄芪有一些禁忌症，实证及阴虚阳亢者忌用；过敏者禁用；特殊人群需谨慎，妊娠期女性使用需医生严格评估指导，哺乳期女性使用需咨询医生，儿童需专业医生辨证论治后谨慎使用。
黄芪具有补气升阳等功效，实证患者本身邪气较盛，使用黄芪可能会导致病邪滞留，使病情加重。比如有表实邪盛、气滞湿阻、食积内停、阴虚阳亢等实证表现的人群，应避免使用黄芪。阴虚阳亢者，其本身就有阴虚火旺的症状，黄芪性温，使用后可能会加重阴虚火旺的情况，出现潮热、盗汗、口干舌燥等症状加重的表现。
过敏者禁用
部分人群可能对黄芪过敏，过敏反应可表现为皮肤瘙痒、皮疹、呼吸困难等。有黄芪过敏史的人群应绝对禁止使用黄芪相关制品。在使用黄芪相关药物或含有黄芪的制剂前，若有过敏体质的人群应提前告知医生，进行过敏风险评估。
特殊人群需谨慎
妊娠期女性：黄芪具有一定的补气作用，在妊娠期使用需谨慎。因为其可能会对子宫产生一定影响，虽然目前具体机制尚不十分明确，但为了避免可能存在的潜在风险，妊娠期女性使用黄芪应在医生的严格评估和指导下进行，医生会根据孕妇的具体情况权衡利弊后决定是否使用。
哺乳期女性：目前关于黄芪对哺乳期女性及婴儿的影响研究相对有限，为了确保安全，哺乳期女性使用黄芪也需要咨询医生，医生会综合考虑黄芪对乳汁分泌以及婴儿健康的潜在影响来给出建议。
儿童：儿童处于生长发育阶段，身体各器官功能尚未完全成熟，黄芪的使用需要格外谨慎。一般不建议自行给儿童使用黄芪，除非在专业医生的辨证论治下，认为儿童的病情确实需要使用黄芪，并且严格掌握好适应证和剂量等情况。因为儿童的体质与成人不同，对药物的耐受和反应可能有差异，不当使用可能会对儿童健康造成不良影响。
