胆囊囊肿的形成有先天性和后天性因素，先天性因素是胚胎发育时胆管发育异常致胆囊囊肿，后天性因素包括慢性胆囊炎反复发作不断刺激胆囊壁增加风险，以及华支睾吸虫感染致胆道系统病变进而波及胆囊引发囊肿，生食或半生食淡水鱼虾及生活在流行区且饮食卫生差人群感染风险高。
后天性因素相关炎症刺激
慢性胆囊炎反复发作：长期存在的慢性胆囊炎会不断刺激胆囊壁，导致胆囊壁发生炎症性改变，进而影响胆囊的正常结构和功能。炎症的反复刺激会使胆囊壁的纤维组织增生、细胞成分改变等，随着时间的推移，可能引起胆囊局部的结构异常，增加胆囊囊肿形成的风险。比如，一些患者可能有既往胆囊炎病史，由于没有得到有效的控制，炎症持续存在，不断对胆囊组织产生刺激，最终引发胆囊囊肿。而且不同年龄段的人群都可能因为慢性胆囊炎的反复发作而面临胆囊囊肿的风险，年龄较大的人群可能因为机体修复能力相对较弱等因素，更容易在慢性炎症刺激下出现胆囊结构的改变。
寄生虫感染
华支睾吸虫感染：华支睾吸虫感染是引起胆道系统病变的重要原因之一，也与胆囊囊肿的形成有一定关联。当人体感染华支睾吸虫后，寄生虫会在胆道系统内寄生，尤其是在胆管内，会引起胆管的炎症反应、胆管上皮的损伤等。长期的华支睾吸虫感染会导致胆管结构和功能的改变，进而可能波及胆囊，使得胆囊出现囊肿样改变。不同生活方式的人群感染风险不同，例如有生食或半生食淡水鱼虾习惯的人群，由于增加了接触华支睾吸虫囊蚴的机会，感染华支睾吸虫的概率升高，也就相应地增加了胆囊囊肿的发生风险。对于儿童来说，如果生活在华支睾吸虫流行地区，且有不良的饮食卫生习惯，同样可能面临感染风险，需要特别注意预防，因为儿童的免疫系统相对不完善，感染后更易引发胆道系统的病变。
