舌头下疼可由口腔局部因素、全身因素及其他因素引起。口腔局部因素包括舌下部位的口腔溃疡、舌下腺炎、临近舌下的牙齿问题；全身因素有感染性疾病（如疱疹性口炎、败血症等）、系统性疾病（如糖尿病、贫血等）；其他因素包含外伤和过敏反应，外伤是进食时咬伤或刮伤，过敏是接触过敏原致过敏反应。
舌下腺炎：舌下腺发生炎症时会引起疼痛。多由舌下腺导管堵塞，如导管内结石等原因导致分泌物潴留、感染引发炎症。各年龄段均可发病，若为导管结石引起，常见于成年人，因为饮食等因素可能导致结石形成。患者舌下腺部位会有肿胀、疼痛，可伴有口水流淌不畅等表现，按压舌下腺部位时疼痛可能加重。
牙齿问题：临近舌下部位的牙齿出现问题也可能牵涉引起舌下疼痛。例如根尖周炎的牙齿，炎症波及到舌下区域可导致疼痛；智齿萌出位置异常，如近中阻生的智齿，其周围组织与舌下区域邻近，炎症时可能引起舌下疼痛。青少年智齿萌出较常见，成年人也可能发生根尖周炎相关牙齿问题。
全身因素引起的舌头下疼
感染性疾病：某些病毒感染，如疱疹性口炎，由单纯疱疹病毒引起，可累及舌下部位，导致疼痛、出现水疱等症状。不同年龄人群都可能感染，儿童由于免疫力相对较低更易感染。患者除舌下疼外，可能伴有发热、全身不适等症状。细菌感染引起的全身感染性疾病，如败血症等严重感染时，也可能出现舌下疼痛的表现，这类情况多见于免疫力低下的人群，如老年人、长期患有慢性疾病者等。
系统性疾病：一些系统性疾病也可能导致舌下疼痛，如糖尿病。糖尿病患者血糖控制不佳时，容易发生口腔感染等问题，可能出现舌下疼痛。糖尿病在各个年龄段都有发病，年龄较大的人群相对更常见。患者除舌下疼外，还可能有多饮、多食、多尿、体重减轻等糖尿病相关症状。另外，贫血患者由于身体缺氧等原因，口腔黏膜可能出现病变，也可能表现为舌下疼痛，各类人群都可能发生贫血，如营养不良性贫血在儿童和孕妇中较常见，缺铁性贫血在各年龄段均可能因铁摄入不足等原因发生。
其他因素
外伤：进食时不小心咬伤舌下部位，或者被尖锐的食物残渣等刮伤舌下黏膜，都可引起疼痛。各年龄段都可能发生，儿童在进食较硬或较烫食物时易发生咬伤，成年人也可能因进食过快等原因导致外伤。一般有明确的外伤史，舌下局部可见伤口、红肿等表现。
过敏反应：如果舌下黏膜接触到某些过敏原，如某些食物（如芒果、海鲜等）、口腔局部使用的药物等，可能引起过敏反应，出现疼痛、肿胀等症状。任何年龄段都可能发生过敏，有过敏体质的人群相对更易出现。患者除舌下疼外，可能伴有口腔其他部位肿胀、瘙痒，甚至全身过敏症状如皮疹、呼吸困难等。
