口臭可能由多种因素引起，包括口腔局部因素如菌斑牙石堆积、龋齿、牙周炎、口腔黏膜病变；全身系统性疾病因素如消化系统疾病（胃炎、胃溃疡、幽门螺杆菌感染）、呼吸系统疾病、糖尿病；以及其他因素如饮食因素（食用刺激性食物）、不良生活习惯（吸烟、长期饮酒、睡眠呼吸暂停综合征）等。不同年龄层人群均可因相应因素出现早晨起床口臭情况。
龋齿：龋洞内容易残留食物残渣，细菌在其中大量繁殖，发酵产生异味。无论是儿童还是成年人，龋齿都可能导致早晨起床口臭。儿童龋齿可能与喜欢吃甜食、口腔卫生习惯差等有关；成年人龋齿可能与口腔卫生维护不当、年龄增长导致牙齿矿化等因素相关。
牙周炎：牙周炎患者牙龈沟内有大量炎性分泌物和细菌，细菌代谢产物会产生异味。各年龄段均可发生，老年人由于牙龈萎缩等原因更容易患牙周炎进而出现口臭；年轻人若有不良口腔习惯，如吸烟、口腔卫生差等，也可能患上牙周炎导致口臭。
口腔黏膜病变：如口腔溃疡，溃疡面会有渗出、坏死组织等，细菌滋生产生异味。不同年龄人群都可能出现口腔溃疡，儿童可能因创伤、维生素缺乏等引发，成年人可能因压力、免疫因素等导致，都会出现早晨起床口臭情况。
全身系统性疾病因素
消化系统疾病
胃炎、胃溃疡：此类患者胃肠消化功能紊乱，可能导致食物在胃内排空延迟，产生的异味向上反流至口腔引起口臭。各年龄层都可能患病，年轻人可能因饮食不规律、精神压力大等引发；老年人可能与胃肠功能衰退等因素有关。
幽门螺杆菌感染：幽门螺杆菌可在胃内产生尿素酶，分解尿素产生氨等有异味的物质，经食管反流至口腔导致口臭。不同年龄人群感染率不同，儿童可能通过密切接触等途径感染，成年人感染率相对较高，且与生活习惯、居住环境等有关。
呼吸系统疾病：如鼻窦炎、支气管炎等，呼吸道产生的分泌物可能带有异味，经口腔呼出导致口臭。各年龄层都可能患呼吸系统疾病，儿童呼吸系统发育不完善，易患呼吸道感染等疾病引发口臭；成年人若患有慢性呼吸系统疾病，也会出现早晨起床口臭情况。
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，体内酮体生成增加，可出现酮症酸中毒，呼出的气体有丙酮味，表现为口臭。糖尿病在各个年龄阶段都有发病可能，老年人患糖尿病的几率相对较高，年轻人也可能因遗传、不良生活方式等患糖尿病。
其他因素
饮食因素：前一天食用大量葱、蒜、韭菜等具有刺激性气味的食物，其气味可能残留于口腔中，导致早晨起床口臭。不同年龄人群都可能因饮食导致口臭，儿童若食用过多甜食、刺激性食物也会出现；成年人聚餐时若食用此类食物，也易引发晨起口臭。
不良生活习惯
吸烟：烟草中的尼古丁等成分会残留在口腔和呼吸道中，长期吸烟的人早晨起床口臭较为常见。各年龄吸烟者都可能出现，青少年吸烟危害更大，成年人吸烟也会导致口腔异味等问题。
长期饮酒：酒精会使口腔干燥，且酒精代谢产物可能通过口腔呼出，导致口臭。不同年龄饮酒者都可能出现，老年人饮酒后若口腔清洁不及时，更容易有口臭问题。
睡眠呼吸暂停综合征：患者睡眠时呼吸不畅，口腔唾液分泌减少，细菌滋生，且可能有呼吸道分泌物残留，导致早晨起床口臭。各年龄层都可能患病，肥胖者、老年人等患病风险相对较高。
