前列腺囊肿的成因包括先天性因素和后天性因素。先天性因素是胚胎发育时中肾导管与中肾旁管发育异常；后天性因素有前列腺腺泡梗阻（包括炎症、结石、增生相关梗阻）和寄生虫感染，炎症致腺泡黏膜充血水肿使腺管狭窄致分泌物潴留，结石阻塞腺管致排出不畅，增生压迫腺管致潴留，寄生虫感染致前列腺管及周围组织慢性炎症形成囊肿。
后天性因素
前列腺腺泡梗阻
炎症相关梗阻：前列腺炎是较为常见的引发前列腺腺泡梗阻的原因之一。前列腺发生炎症时，会导致腺泡黏膜发生充血、水肿，进而引起腺管狭窄，使得腺泡内分泌物潴留，最终形成囊肿。这种情况在成年男性中较为多见，尤其是长期患有慢性前列腺炎且未得到有效控制的患者，炎症的持续刺激不断影响前列腺腺泡的正常功能，增加了前列腺囊肿的发生风险。
结石相关梗阻：前列腺结石也可能导致腺泡梗阻从而引发囊肿。前列腺结石会阻塞前列腺腺管，使前列腺液排出不畅，长期如此就容易形成囊肿。有前列腺结石病史的患者，相对而言更易出现前列腺囊肿的情况，结石的存在持续干扰前列腺内部的液体循环和排泄，是后天性因素中不可忽视的一点。
增生相关梗阻：随着男性年龄增长，前列腺增生的发病率逐渐升高。前列腺增生时，增大的腺体组织会压迫尿道及前列腺腺管，造成腺管梗阻，导致分泌物潴留形成囊肿。一般在50岁以上的男性中，前列腺增生的发生率较高，进而前列腺囊肿的发生风险也会相应增加，年龄因素在此起到了重要作用，随着年龄的增加，前列腺组织的生理变化使得这种梗阻性因素导致囊肿的可能性增大。
寄生虫感染：某些寄生虫感染也可能引起前列腺囊肿。例如，寄生虫如棘球蚴等可寄生在前列腺内，引起前列腺管及周围组织发生慢性炎症反应，逐渐形成囊肿。在一些有寄生虫流行地区生活的人群，或者有过寄生虫感染史的患者中，需要考虑寄生虫感染导致前列腺囊肿的可能性，寄生虫在前列腺内的寄生和繁殖过程会破坏前列腺组织的正常结构和功能，引发囊肿形成。
