女性泌尿系感染受多种因素影响，包括生理结构因素（尿道短宽直且距肛门近易让细菌入侵）、性生活因素（性生活易挤入细菌，特殊时期及多个性伴侣增风险）、卫生习惯因素（不注意外阴清洁致细菌滋生感染）、雌激素水平因素（绝经后雌激素低致局部抵抗力降）、泌尿系统结构异常因素（畸形或结石致尿液引流不畅或潴留易感染）、机体免疫力因素（免疫力低下如患慢性病、用免疫抑制剂易感染）。
女性尿道较短、宽且直，距离肛门较近，这使得细菌更容易从肛门方向侵入尿道引发感染。例如，女性尿道平均长度约3-5厘米，而男性尿道较长且有生理性弯曲，相比之下女性尿道的解剖结构更利于细菌入侵。在性生活等活动中，可能会将周围的细菌挤入尿道，增加感染风险。
性生活因素
性生活时，会阴部的细菌可能被挤入尿道，从而引发泌尿系感染。尤其是女性在经期、妊娠期等特殊时期，性生活更容易导致感染发生。另外，多个性伴侣也会增加女性泌尿系感染的概率，因为不同性伴侣可能携带不同的细菌，增加了尿道感染的病原体来源。
卫生习惯因素
不注意外阴清洁，如不经常清洗外阴、不勤换内裤等，会使细菌在会阴部滋生，进而容易侵入尿道引起感染。例如，会阴部的大肠杆菌等细菌如果没有及时清洁，就可能顺着尿道上行感染泌尿系统。
雌激素水平因素
绝经后女性雌激素水平降低，阴道和尿道黏膜变薄、萎缩，局部抵抗力下降，容易发生泌尿系感染。因为雌激素对维持尿道黏膜的完整性和局部防御功能有重要作用，雌激素水平降低时，尿道黏膜的防御能力减弱，细菌更容易定植和感染。
泌尿系统结构异常因素
如先天性泌尿系统畸形，像输尿管开口异位等情况，会使尿液引流不畅或尿液反流，导致细菌容易在局部定植繁殖，引发泌尿系感染。另外，患有泌尿系统结石等疾病时，结石会梗阻尿路，造成尿液潴留，为细菌的生长繁殖提供了有利环境，从而增加感染的发生几率。
机体免疫力因素
当女性机体免疫力低下时，如患有糖尿病等慢性疾病、长期使用免疫抑制剂等情况，身体对细菌的抵抗力下降，更容易发生泌尿系感染。例如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，尿液中含糖量高，有利于细菌生长，同时机体的免疫功能也受到影响，使得泌尿系统更容易受到细菌侵袭。
