泌尿系感染由病原体入侵、机体自身因素、生活方式因素相关，病原体可经上行、血行、淋巴道感染，女性、婴幼儿、老年人等因自身特点易感染，泌尿系统结构或功能异常、免疫力低下易引发，个人卫生、饮水少、憋尿等生活方式也会增加感染风险。
病原体入侵：最常见的病原体是大肠埃希菌，约占门诊患者的80%-90%，此外，变形杆菌、克雷伯菌等也可引起感染。病原体可通过上行感染（病原体从尿道外口进入尿道，然后沿尿道黏膜上行至膀胱、输尿管甚至肾脏）、血行感染（病原体通过血液循环到达肾脏和尿路其他部位引起感染，如败血症时细菌可随血流到达肾脏）、淋巴道感染（盆腔和肛周的淋巴管与肾周围的淋巴管有交通支，当盆腔炎症、阑尾炎等时，病原体可从淋巴道感染泌尿系统）等途径侵入尿路。
机体自身因素
性别：女性尿道短、宽且直，距离肛门近，更容易被肠道细菌污染，所以女性泌尿系感染的发生率明显高于男性。例如，青春期女性由于生理结构特点，泌尿系感染的风险相对较高；而老年女性由于雌激素水平降低，局部抵抗力下降，也容易发生泌尿系感染。
年龄：婴幼儿尿道黏膜娇嫩，容易被损伤和感染，且尿道口常被粪便污染，增加了感染机会；老年人机体抵抗力下降，常伴有前列腺增生等疾病，导致尿路梗阻，尿液排出不畅，易引发感染。
泌尿系统结构或功能异常：如尿路结石可引起尿液梗阻，使尿液潴留，有利于细菌生长繁殖；尿路畸形（如肾盂输尿管连接处狭窄等）会影响尿液的正常流通，增加感染风险；膀胱输尿管反流可使尿液从膀胱逆流至输尿管甚至肾脏，从而导致感染。
免疫力低下：患有糖尿病等基础疾病的患者，机体抵抗力下降，容易发生泌尿系感染；长期使用免疫抑制剂的患者，如器官移植后服用免疫抑制剂的患者，免疫系统受到抑制，也易遭受病原体侵袭引发感染。
生活方式因素
个人卫生：不注意外阴部清洁，尤其是女性，大便后擦拭方向不当（从肛门向尿道方向擦拭），容易将肠道细菌带到尿道外口引起感染；性生活时不注意卫生，也可能将细菌带入尿道导致感染。
饮水过少：饮水少会导致尿液生成减少，尿液对尿道的冲刷作用减弱，细菌容易在尿路滋生繁殖。
憋尿：长时间憋尿使尿液在膀胱内停留时间过长，为细菌生长提供了良好的环境，增加了泌尿系感染的可能性。
