碘伏与碘酒在成分、性状、消毒原理、适用范围、过敏反应及保存方面存在不同，碘伏主要成分是聚维酮碘，红棕色液体，刺激性小，用于多种皮肤黏膜消毒，过敏概率低，避光密封阴凉保存时间长；碘酒主要成分是碘和酒精，红棕色透明液体，有挥发性和强刺激性，用于皮肤消毒，过敏概率高，碘过敏者禁忌，需避光密封保存且时间较短。
一、成分方面
碘伏是单质碘与聚乙烯吡咯烷酮（PVP）的不定型结合物，主要成分是聚维酮碘，其有效碘含量相对稳定。
碘酒也叫碘酊，是碘、碘化钾溶于酒精制成的溶液，主要成分是碘和酒精。
二、性状方面
碘伏通常为红棕色液体，稳定性较好，刺激性相对较小。
碘酒一般为红棕色透明液体，因含有酒精，具有挥发性，且刺激性相对较强。
三、消毒原理方面
碘伏利用释放出的游离碘发挥杀菌作用，它可以使菌体蛋白质变性，对细菌、病毒、真菌等都有杀灭作用。
碘酒中的碘具有强大的杀菌作用，它可破坏病原体的细胞膜结构及蛋白质分子，其杀菌力强且作用迅速。
四、适用范围方面
碘伏适用于皮肤、黏膜的消毒，也可用于手术前手消毒、注射部位皮肤消毒等，对皮肤的刺激性小，可用于破损皮肤的消毒，比如小面积的伤口等。对于新生儿脐带部位的消毒也常用碘伏，因为其刺激性小，利于新生儿娇嫩皮肤的护理。
碘酒常用于皮肤消毒，但由于其刺激性强，不适合用于黏膜和敏感部位的消毒，也不适合用于破损皮肤的消毒，因为会引起较强烈的疼痛。比如不能用于口腔黏膜、会阴等部位的消毒。
五、过敏反应方面
碘伏引起过敏反应的概率较低，对于一般人群相对安全，但极少数人可能对碘伏中的成分过敏。
碘酒引起过敏反应的概率相对较高，因为其中的酒精可能会引起部分人的过敏，而且碘本身也可能导致过敏，在使用碘酒前，对于有碘过敏史的人群是绝对禁忌的。比如有过明确碘过敏史的患者，使用碘酒可能会引发严重的过敏反应，如过敏性休克等，所以这类人群必须避免使用碘酒消毒。
六、保存方面
碘伏应避光、密封保存于阴凉处，保存时间相对较长，一般开封后在合适条件下可保存较长时间不变质。
碘酒需要避光、密封保存，由于酒精易挥发，保存不当会导致碘酒浓度改变，从而影响消毒效果，所以要注意密封保存，且保存时间相对碘伏较短，开封后需尽快使用完。
