新生儿肝炎综合征诊断需从病史与症状询问入手，了解孕期及出生情况、黄疸等症状；通过肝功能、感染、代谢相关检查辅助诊断；腹部超声等影像学检查协助鉴别；必要时行肝活检明确，综合多方面信息全面分析判断，考虑新生儿特殊生理状况谨慎选检确保准确。
症状方面：新生儿多表现为黄疸，一般在出生后2-3周出现且持续不退或退而复现，同时可能伴有肝脾肿大，部分患儿还会有食欲减退、呕吐、大便颜色变浅等表现。
实验室检查
肝功能检查：血清胆红素升高，以结合胆红素升高为主，谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）等可不同程度升高，反映肝细胞受损情况。血清白蛋白可能降低，球蛋白可升高，反映肝脏合成功能及可能存在的免疫反应。
感染相关检查：进行TORCH筛查，如弓形虫IgM、风疹病毒IgM、巨细胞病毒IgM、单纯疱疹病毒IgM等检测，若阳性提示可能存在宫内感染因素导致新生儿肝炎综合征。另外，还需进行细菌感染相关检查，如血培养等，以排除新生儿败血症等感染性疾病引起的类似黄疸等表现。
代谢相关检查：进行甲状腺功能检查，因为甲状腺功能减退等代谢性疾病也可能出现类似新生儿肝炎综合征的黄疸表现；进行遗传代谢病相关筛查，如半乳糖血症等相关代谢指标检测，以排除遗传代谢性疾病导致的肝脏病变。
影像学检查
腹部超声检查：可观察肝脏大小、形态、实质回声等情况，还能了解胆道系统是否存在异常，如胆道闭锁等情况，胆道闭锁时超声可能显示胆囊偏小或消失、肝外胆管显示不清等表现，这对鉴别新生儿肝炎综合征和胆道闭锁等疾病有重要意义。
CT或MRI检查：对于一些复杂情况，如怀疑肝脏占位性病变等，CT或MRI检查可更清晰地显示肝脏内部结构、病变部位及范围等，但一般作为进一步检查手段，因为新生儿对辐射等有一定敏感性，需谨慎选择。
肝活检
肝活检是诊断新生儿肝炎综合征的重要手段之一，通过肝组织病理学检查，可以明确肝脏病变的性质和程度，如可见肝细胞变性、坏死、炎症细胞浸润等病理改变，但肝活检属于有创检查，需严格掌握适应证，充分评估风险后进行。
新生儿肝炎综合征的诊断需要综合病史、症状、实验室检查、影像学检查甚至肝活检等多方面信息进行全面分析判断，在整个诊断过程中要充分考虑新生儿的特殊生理状况，如新生儿肝脏功能发育不完善等特点，谨慎选择检查项目，确保诊断的准确性。
