非淋菌性尿道炎会引发尿道分泌物异常、尿道瘙痒、尿频尿急、尿痛等症状，男性晨起尿道口有少量稀薄黏液性分泌物，女性尿道分泌物少易被忽视；尿道瘙痒程度、持续时间不一，儿童表述不清，老年表现可能不同；尿频指排尿次数增多，尿急是有尿意难控制，受生活方式和基础疾病影响；尿痛是排尿时烧灼样疼痛，女性因解剖等因素可能受阴道局部状况影响，男性主要集中在尿道部位。
女性表现：女性非淋菌性尿道炎时尿道分泌物相对男性更少，部分患者可能仅有尿道轻微瘙痒或不适感，分泌物不明显，容易被忽视。这与女性尿道解剖结构相对短直，但分泌物产生机制类似男性，不过由于女性尿道外口周围有较多其他菌群等因素影响，表现可能不如男性典型。
尿道瘙痒
程度与持续时间：患者会感到尿道内或尿道口有不同程度的瘙痒感，这种瘙痒感可轻可重，持续时间较长，时轻时重。比如有的患者可能整天都有轻微瘙痒，在排尿前后或注意力集中时瘙痒感可能会稍明显。这是由于病原体刺激尿道黏膜神经末梢引起的感觉异常。
年龄差异：儿童患者尿道瘙痒可能表述不清，多表现为搔抓会阴部等与尿道相关的区域，需要家长仔细观察其行为异常来判断。老年患者可能因为感觉神经敏感性变化等因素，瘙痒感的表现可能与中青年有所不同，但本质是病原体对尿道黏膜的刺激。
尿频、尿急
频率变化：患者会出现排尿次数增多，即尿频，正常成人白天排尿4-6次，夜间0-2次，而患者可能超过这个频率。尿急表现为一有尿意就迫不及待地需要排尿，难以控制。这是因为炎症刺激尿道黏膜，使尿道黏膜感受器敏感性增高，导致膀胱频繁收到排尿信号。
生活方式影响：如果患者同时有饮水过多等生活方式因素，可能会加重尿频症状，但非淋菌性尿道炎本身导致的尿频尿急是相对独立于饮水的异常排尿表现。对于有基础疾病如糖尿病的患者，合并非淋菌性尿道炎时，尿频尿急症状可能会更复杂，需要综合考虑糖尿病对泌尿系统的影响以及非淋菌性尿道炎的炎症刺激。
尿痛
疼痛性质：排尿时尿道有烧灼样疼痛，疼痛程度因人而异，有的患者疼痛较轻，仅在排尿瞬间有轻微不适，有的患者疼痛较明显，排尿时刺痛感较为强烈。这是由于炎症导致尿道黏膜充血、水肿，尿液通过时刺激受损的黏膜引起疼痛。
性别差异：女性尿痛可能还与阴道口、尿道口距离近有关，容易合并阴道炎症等情况，在排尿时疼痛可能会受到阴道局部状况的影响。男性尿痛则主要集中在尿道部位的疼痛感觉。
