衣原体尿路感染早期症状因人群不同有差异，男性有尿道不适、排尿异常；女性尿道、阴道症状及排尿异常不典型；儿童患者症状不典型；老年患者症状不明显且可能有非特异性全身不适；不安全性行为及有相关病史人群症状有不同表现。
男性患者早期症状：
尿道不适：发病早期可能出现尿道刺痒、轻微刺痛等感觉，这种不适感可能会在排尿时略有加重。部分患者还可能发现尿道分泌物，初期分泌物量较少，呈稀薄状，颜色多为透明或微白，随着病情发展，分泌物可能会变得浓稠，晨起时可能会在尿道口见到少量粘液性分泌物，形成所谓的“糊口”现象。
排尿异常：可能出现尿频的情况，即排尿次数较以往增多，但每次尿量一般不会明显减少。少数患者可能会出现尿急，表现为突然产生强烈的排尿欲望，难以控制。
女性患者早期症状：
尿道症状：相比男性，女性衣原体尿路感染早期尿道症状可能相对不典型，部分患者会有尿道轻微瘙痒感，也可能出现尿道分泌物，但一般较男性患者少且稀薄。
阴道症状：可能出现阴道分泌物增多的情况，分泌物性状可能无特异性改变，部分患者阴道分泌物会变得混浊，还有可能出现阴道瘙痒等不适症状。
排尿异常：同样可能出现尿频、尿急症状，与男性类似，但程度可能因人而异。
不同年龄人群的差异体现：
儿童患者：儿童衣原体尿路感染相对较少见，但一旦发生，早期症状可能不太典型。比如婴幼儿可能表现为排尿时哭闹，这是因为尿道不适或疼痛导致，还可能出现尿布区域的不适，家长可能会发现婴幼儿尿布有异味等情况。年长儿童可能会表述尿道有轻微不适，但由于表达能力有限，往往需要家长密切观察其排尿相关的异常表现。
老年患者：老年患者由于机体功能衰退等因素，早期症状可能更不明显。可能仅表现为轻微的尿频，或者没有明显的局部症状，而更多地可能出现一些非特异性的全身不适，如乏力等，但这也需要结合其他检查来综合判断是否为衣原体尿路感染引起。
与生活方式相关的影响：如果本身有不安全性行为等不良生活方式，在接触衣原体病原体后，更容易较快出现上述早期症状。因为不安全性行为是衣原体传播的重要途径之一，会增加感染的风险和加快症状出现的可能。
有相关病史人群的情况：如果既往有泌尿系统其他感染病史等，再次感染衣原体时，机体的免疫等反应可能与常人不同，早期症状可能会有所不同，比如可能症状出现相对较隐匿，或者与单纯初次感染的症状有差异，需要医生结合病史进行详细的鉴别诊断。
