甲亢不治会带来多方面严重后果，对心血管系统可致心悸、心律失常、心脏扩大、心衰；对骨骼系统会使骨量丢失、增加骨质疏松及骨折风险；对消化系统引起多食消瘦、腹泻、营养吸收不良，影响儿童生长发育；对生殖系统致女性月经紊乱、不孕，男性性欲减退、阳痿；对神经系统引发情绪及神经精神问题，影响儿童智力发育；对眼部可致眼部病变，重者失明。
甲亢时甲状腺激素分泌过多，会使心脏负担加重。患者可能出现心悸、心动过速，严重时可导致心律失常，如心房颤动等。长期不治疗还可能引发心脏扩大、心力衰竭。研究表明，甲亢患者发生心力衰竭的风险显著高于正常人群，且年龄较大的患者更易受到影响，因为随着年龄增长，心脏本身的储备功能就会下降，甲亢带来的额外负担更容易打破心脏的平衡状态。
对骨骼系统的影响
甲状腺激素过多会影响钙的代谢，导致骨量丢失，增加骨质疏松的发生风险。患者可能出现骨痛、骨折等情况，尤其是绝经后的女性甲亢患者，本身就处于骨质疏松的高危阶段，甲亢若不及时治疗，会进一步加速骨量的流失，使骨折的可能性大幅增加。
对消化系统的影响
甲亢会使胃肠蠕动加快，患者可能出现多食、消瘦，但体重下降的情况，同时还可能伴有腹泻等症状。长期如此会导致营养吸收不良，影响患者的整体健康状况，对于儿童患者来说，还会影响其生长发育，因为充足的营养是儿童生长的基础，胃肠功能紊乱会阻碍营养物质的正常摄取和利用。
对生殖系统的影响
在女性中，甲亢可能导致月经紊乱，如月经量减少、周期不规律等，严重时甚至会影响受孕，增加不孕的几率；在男性中，可能出现性欲减退、阳痿等生殖系统功能异常的情况，这会对患者的生育能力和家庭生活产生不利影响，尤其对于有生育计划的人群来说，是需要重点关注的方面。
对神经系统的影响
患者可能出现情绪激动、烦躁不安、失眠等症状，长期不治疗还可能导致神经精神方面的问题加重，如出现焦虑症、抑郁症等心理疾病的风险增加。对于儿童甲亢患者，神经系统发育尚未完全成熟，甲亢不及时控制可能会影响其智力发育和学习能力，因为神经系统的正常功能对于儿童的认知、行为等方面有着重要作用。
对眼部的影响
部分甲亢患者会出现眼部病变，即甲状腺相关性眼病。轻者可能仅有眼部不适、眼裂增宽等表现，重者可出现眼球突出、视力下降，甚至失明。年龄较小的患者眼部组织相对娇嫩，甲亢引发的眼部病变可能对其视力发育造成更严重的损害，需要密切关注眼部情况，及时采取相应措施。
