新生儿低血糖的原因包括葡萄糖储存不足和葡萄糖消耗增加以及内分泌和代谢性疾病。葡萄糖储存不足与早产、小于胎龄儿、围生期缺氧、先天性心脏病有关；葡萄糖消耗增加与新生儿窒息、重症感染、寒冷损伤、糖尿病母亲婴儿有关；内分泌和代谢性疾病包括垂体功能低下、先天性甲状腺功能减退症、遗传代谢性疾病等影响葡萄糖代谢导致低血糖。
小于胎龄儿：这类胎儿在宫内营养相对受限，肝糖原等储存物质较少。
围生期缺氧：缺氧会影响胎儿能量代谢，导致葡萄糖储存减少。比如，分娩过程中发生窒息等围生期缺氧情况，会干扰胎儿的糖代谢，使葡萄糖储存不足。
先天性心脏病：先天性心脏病患儿可能存在心血管功能异常，影响机体的能量供应和葡萄糖储存。例如，复杂型先天性心脏病患儿，由于心脏结构和功能异常，导致葡萄糖储存相关的代谢过程受到影响。
葡萄糖消耗增加
新生儿窒息：新生儿窒息时，机体处于应激状态，代谢率增高，葡萄糖消耗增加。窒息后机体的无氧代谢增强，葡萄糖分解加快，导致葡萄糖消耗过多。
重症感染：新生儿感染时，病原体的侵袭会引起机体的炎症反应，炎症反应过程中机体的代谢率升高，葡萄糖消耗增加。例如，败血症患儿，感染导致机体处于高代谢状态，葡萄糖消耗明显增多。
寒冷损伤：新生儿体温调节中枢发育不完善，寒冷时机体为维持体温，会增加产热，而产热过程需要消耗大量葡萄糖。比如，在寒冷环境中未得到及时保暖的新生儿，会因寒冷损伤而增加葡萄糖消耗。
糖尿病母亲婴儿：糖尿病母亲体内血糖较高，胎儿长期处于高血糖环境，胰岛细胞增生，胰岛素分泌增多。出生后，母亲血糖供应中断，而婴儿体内胰岛素水平较高，导致葡萄糖利用增加，消耗过多。
内分泌和代谢性疾病
垂体功能低下：垂体是调节内分泌的重要器官，垂体功能低下会影响相关激素的分泌，从而影响葡萄糖的代谢调节。例如，促肾上腺皮质激素缺乏等情况，会导致糖皮质激素分泌不足，影响糖原异生，使葡萄糖产生减少。
先天性甲状腺功能减退症：甲状腺激素缺乏会影响机体的代谢率，甲状腺激素能促进机体的物质代谢，缺乏时代谢率降低，葡萄糖消耗减少，但同时甲状腺激素缺乏还会影响糖原分解等过程，导致葡萄糖产生不足，最终引起低血糖。
遗传代谢性疾病：某些遗传代谢性疾病会影响葡萄糖的代谢途径。例如，半乳糖血症是由于患儿体内缺乏半乳糖-1-磷酸尿苷转移酶，使半乳糖不能正常代谢，进而影响葡萄糖的代谢平衡；糖原累积症是由于糖原合成和分解相关的酶缺陷，导致糖原代谢异常，引起血糖调节紊乱，出现低血糖。
