大多数单纯性肾囊肿无症状，部分患者可能出现腰部、腹部不适或疼痛，少数有血尿，囊肿大时可有腹部肿块，有时会引起高血压，很少致肾功能减退，不同人群症状表现有差异。
部分患者可能出现的症状
腰部、腹部不适或疼痛
发生机制：当囊肿较大时，会压迫周围组织、牵拉肾包膜等，从而引起腰部或腹部的隐痛、胀痛等不适。例如，囊肿直径超过5cm时，这种压迫相关的疼痛症状相对更易出现。
具体表现：疼痛程度不一，有的患者可能只是偶尔感到腰部酸胀，有的则可能疼痛较为明显，呈持续性或间歇性发作，活动后可能会加重。对于年龄较大的患者，本身可能存在腰椎等方面的退变，囊肿引起的疼痛可能会被误认为是腰椎问题，需要注意鉴别。
血尿
发生情况：少数单纯性肾囊肿患者可能出现血尿。这是因为囊肿壁的血管破裂等原因导致。一般为镜下血尿，即通过尿常规检查可发现红细胞，但肉眼看不到尿液变红；少数情况下也可能出现肉眼血尿，此时尿液呈洗肉水样。对于有血尿症状的患者，尤其是年龄较大的，需要进一步排查是否存在其他更严重的肾脏疾病。
腹部肿块
出现情形：当囊肿较大时，有的患者可在腹部摸到肿块。一般来说，囊肿直径大于10cm时，腹部肿块相对较易被触及。但这种情况相对少见，而且摸到肿块时也需要与其他腹部肿物相鉴别，比如肾脏肿瘤等。
高血压
关联情况：单纯性肾囊肿有时可能会引起高血压。其发生机制可能与囊肿压迫肾脏，导致肾素-血管紧张素-醛固酮系统激活有关。如果囊肿较大，这种引起高血压的可能性相对增加。对于本身有高血压的患者，如果发现同时存在单纯性肾囊肿，需要关注囊肿情况对血压控制的影响，部分患者在囊肿得到相应处理后，血压可能会有所改善。
肾功能减退
发生条件：一般单纯性肾囊肿很少导致肾功能减退，但如果双侧肾脏有多个较大的囊肿，压迫肾实质，长期下去可能会影响肾脏的正常功能，导致肾小球滤过率下降等，进而出现肾功能减退相关表现，如乏力、食欲减退等。不过这种情况相对比较罕见，多见于双侧多发性较大囊肿的患者。对于有基础肾脏疾病或年龄较大、存在多个囊肿的患者，需要定期监测肾功能。
不同年龄、性别、生活方式和病史的人群在单纯性肾囊肿症状表现上可能会有一定差异。比如老年患者，可能同时合并其他慢性疾病，其症状可能会被其他疾病的症状所掩盖；男性和女性在症状上并没有明显的性别特异性差异，但男性可能在一些体力活动后，囊肿相关的疼痛等症状可能会更明显地表现出来；长期久坐、缺乏运动的人群，可能囊肿引起的腰部不适等症状相对更易察觉；有肾脏疾病家族史的人群，在出现相关症状时需要更加警惕单纯性肾囊肿等肾脏结构异常的可能。
