脑炎后遗症显现时间有个体差异，与病因、病情严重程度、治疗是否及时等因素有关，病毒性、细菌性脑炎显现时间因病因不同有差异，重度、轻度脑炎因病情严重程度显现时间不同，治疗及时与否也会使脑炎患者显现后遗症时间不同。
不同病因相关情况
病毒性脑炎：一般来说，部分患者在脑炎发病后的数天至数周内可能开始显现出后遗症，例如单纯疱疹病毒性脑炎，有些患者可能在急性期后1-2周左右就出现认知功能减退、癫痫发作等后遗症表现；而有些病毒性脑炎病情相对较轻且治疗及时，可能在数月后才逐渐显现出轻度的运动协调障碍等后遗症。不同年龄人群中，儿童患病毒性脑炎后出现后遗症的时间也有差异，儿童的神经系统处于发育阶段，对于病毒侵犯的反应可能相对更敏感，可能在较短时间内就出现后遗症相关表现，而成人相对可能时间稍有不同，但总体范围大致在数天到数月。
细菌性脑炎：病情通常相对较重，部分患者可能在脑炎发病后1-3周左右开始显现后遗症，像化脓性脑炎，若治疗不及时或病情控制不佳，可能较早出现肢体瘫痪、智力下降等后遗症；对于老年患者，本身机体功能相对较弱，血脑屏障功能也有所下降，细菌性脑炎后出现后遗症的时间可能相对较早，可能在发病后1-2周左右就会有一些后遗症迹象显现，而年轻患者可能时间稍晚，但也多在数周内开始出现不同程度的后遗症表现。
病情严重程度相关情况
重度脑炎：患者病情严重，脑组织受损较严重，往往在脑炎发病后较短时间内就可能显现出明显的后遗症，可能在发病后1周左右就会出现昏迷、肢体严重瘫痪等严重后遗症表现；而轻度脑炎患者，脑组织受损相对较轻，可能在发病后数周甚至数月后才逐渐显现出一些相对较轻的后遗症，如轻度的记忆力减退等。对于儿童重度脑炎患者，由于其神经系统代偿能力相对较弱，可能更早出现后遗症，而老年重度脑炎患者，本身身体机能衰退，恢复能力差，也会较早出现后遗症相关表现。
病情较轻脑炎：经过及时有效的治疗，部分患者可能在数月后才逐渐显现出一些轻微的后遗症，比如轻度的注意力不集中等，对于不同年龄的患者，儿童病情较轻脑炎后出现后遗症时间相对成人可能稍早一些，因为儿童神经系统发育尚未成熟，对脑组织受损的耐受程度相对较低。
治疗及时性相关情况
治疗及时的脑炎：如果脑炎能够在发病后尽快得到规范治疗，那么患者显现后遗症的时间可能会相对推迟，有些患者可能在发病后数月甚至更长时间才逐渐出现一些较轻的后遗症；而治疗不及时的脑炎患者，脑组织受损持续进展，可能在发病后较短时间内就较早显现出严重的后遗症，例如治疗不及时的脑炎可能在发病后2-3周就出现严重的智力障碍等后遗症。对于婴幼儿脑炎患者，由于其身体抵抗力弱，治疗不及时更容易较早出现后遗症，所以及时治疗对于婴幼儿脑炎患者尤为重要，能一定程度上推迟后遗症显现时间或减轻后遗症严重程度。
