阴茎短小受遗传、内分泌、肥胖、发育期间不良因素及生活方式等多因素影响，遗传因素使阴茎大小受家族基因控制，内分泌中雄激素水平及相关疾病会影响，肥胖因雌激素增多抑制雄激素致阴茎短小，发育期间营养不良、药物、疾病会干扰，吸烟致阴茎海绵体血管收缩影响发育，酗酒损害器官功能干扰激素代谢，儿童青少年需家长关注生长发育、保证营养、避免不良习惯，成年男性阴茎短小影响生活应及时就医。
内分泌因素
雄激素水平：雄激素是影响阴茎发育的重要内分泌激素。在胎儿时期，雄激素能促进阴茎的分化与发育；在青春期，雄激素水平的正常与否会影响阴茎的进一步生长。如果体内雄激素分泌不足，例如先天性睾丸发育不良等疾病，会导致雄激素产生减少，从而影响阴茎的正常发育，使阴茎短小。一般来说，正常男性体内雄激素水平维持在一定范围内才能保证阴茎正常的生长发育进程。
其他内分泌相关疾病：一些内分泌系统的疾病也可能间接影响阴茎发育。比如垂体疾病导致促性腺激素分泌异常，进而影响睾丸分泌雄激素的功能，最终影响阴茎发育。
肥胖因素
肥胖人群中，过多的脂肪会堆积在腹部等部位，体内的雌激素会增多。因为脂肪组织中的芳香化酶可以将雄激素转化为雌激素，雌激素水平升高会抑制雄激素的作用，从而影响阴茎的发育，导致阴茎相对短小。同时，肥胖可能还会伴有内分泌代谢紊乱等情况，进一步干扰阴茎正常的生长发育环境。
发育期间的不良因素
营养不良：在青少年生长发育期间，如果营养不良，缺乏蛋白质、维生素等重要营养物质，会影响身体的整体发育，包括阴茎的发育。例如，长期挑食、偏食导致身体得不到充足的营养供应，就可能影响阴茎正常的生长发育，使其发育受限出现短小情况。
药物影响：如果在发育期间不合理使用某些药物，也可能对阴茎发育产生不良影响。比如长期使用某些激素类药物等，可能会干扰内分泌平衡，进而影响阴茎的正常发育。
疾病影响：一些先天性疾病，如尿道下裂等，除了会造成尿道开口异常外，还可能伴有阴茎发育短小的情况。另外，患有一些影响生殖系统发育的慢性疾病，在疾病过程中身体处于消耗状态，也会影响阴茎的正常发育。
生活方式因素
吸烟：吸烟会影响血管的功能，导致阴茎海绵体的血管收缩，影响阴茎的血液供应。长期吸烟可能会阻碍阴茎正常的生长发育，增加阴茎短小的风险。因为阴茎的正常发育需要充足的血液供应来提供营养等物质，血液供应不足会影响其正常生长。
酗酒：大量长期饮酒会损害肝脏等器官的功能，影响激素的代谢等。肝脏是雄激素代谢的重要器官，酒精会干扰肝脏对激素的代谢过程，进而影响雄激素水平，不利于阴茎的正常发育，可能导致阴茎短小。
对于儿童及青少年来说，家长要关注其生长发育情况，保证合理的营养摄入，避免不良生活习惯的影响；对于成年男性，如果发现阴茎短小影响到正常生活等情况，应及时就医，进行相关检查，明确原因后采取相应的措施。
