牙齿矫正可能存在治疗过程中的不适、治疗周期较长及效果不确定性、经济成本较高等弊端。治疗过程中儿童初期有酸痛影响进食、成人口腔清洁难；治疗周期长，儿童易有心理等影响，成人影响工作社交，且效果有不确定可能复发；矫治器及复诊费用高，家庭经济压力大。
一、治疗过程中的不适
佩戴矫治器初期的不适
对于儿童来说，在刚佩戴固定矫治器时，牙齿会有酸痛感，影响进食，尤其是在进食较硬、较黏食物时更为明显。这是因为矫治器对牙齿施加了外力，牙齿周围的牙周组织需要适应这种变化，儿童可能会因为疼痛而影响食欲，进而影响营养摄入，尤其是正在生长发育阶段的儿童，营养不足可能会影响牙齿周围骨骼等组织的正常发育。对于成年人，初期也可能出现牙齿酸胀、咀嚼无力等情况，影响日常生活中的咀嚼功能，比如难以咀嚼肉类等较硬食物。
口腔清洁难度增加
无论是佩戴固定矫治器还是隐形矫治器，都增加了口腔清洁的难度。以固定矫治器为例，牙齿上的托槽、弓丝等结构会阻碍牙刷的正常清洁，容易导致食物残渣残留，长期以往可能引发龋齿、牙龈炎等问题。儿童由于自我口腔清洁意识相对较弱，家长需要花费更多精力帮助其清洁口腔，若清洁不彻底，不仅会影响牙齿矫正效果，还可能引发口腔疾病，影响口腔健康。成年人如果口腔清洁不到位，同样会面临龋齿和牙龈炎的风险，而且可能因为工作等原因，难以保证每次进食后都能及时、彻底清洁口腔。
二、治疗周期较长及效果不确定性
治疗周期较长
牙齿矫正需要较长的时间，一般固定矫治器矫正可能需要1-3年甚至更长时间，隐形矫治器相对时间可能稍短，但也通常需要数月至1年多不等。对于儿童来说，漫长的矫正周期可能会影响其心理状态，比如可能因为牙齿的不美观而产生自卑等情绪，而且在矫正过程中需要定期复诊，可能会影响学习和生活安排。成年人也需要投入大量的时间和精力，比如定期到医院复诊调整矫治器等，可能会对工作和社交生活产生一定影响。
效果不确定性
虽然大多数人通过牙齿矫正可以获得较为理想的牙齿排列和咬合关系，但也存在矫正效果不理想的情况。比如可能出现牙齿复发的情况，即矫正结束后牙齿又逐渐恢复到原来的位置。儿童处于生长发育阶段，颌骨可能会有一定的生长变化，这也增加了矫正效果不稳定的风险，如果在矫正过程中颌骨发育出现异常情况，可能需要重新调整矫正方案甚至影响最终矫正效果。成年人的颌骨已经发育完成，相对儿童来说效果相对稳定，但也可能因为个体牙齿基础情况不同，如牙齿移动的难度、牙槽骨的条件等因素，导致最终效果与预期有差异。
三、经济成本较高
矫治器及复诊费用
牙齿矫正的费用相对较高，不同类型的矫治器价格差异较大。固定矫治器价格相对较为亲民，但如果选择隐形矫治器等高端矫治器，费用会大幅增加。儿童进行牙齿矫正时，家长需要考虑长期的经济投入，而且在矫正过程中需要定期复诊，每次复诊都可能产生一定的费用，这对于家庭来说是一笔不小的开支。成年人也需要承担矫治器的费用以及多次复诊的费用，可能会因为经济因素而在一定程度上影响矫正方案的选择。
