脑囊虫病的诊断需从病史采集、体格检查、实验室检查、影像学检查及鉴别诊断多方面进行。病史采集要询问流行病学史和症状表现；体格检查重点做神经系统检查；实验室检查包括脑脊液和血液检查，脑脊液检查有常规、生化及囊虫特异性抗体检测，血液检查有囊虫抗体及血常规；影像学检查有头颅CT和MRI，各有不同时期表现；需与其他颅内病变如脑肿瘤、病毒性脑炎、结核性脑膜炎等鉴别。
症状表现：了解患者是否出现头痛、癫痫发作、视力障碍、恶心呕吐、精神症状等。不同年龄患者症状可能有差异，儿童可能更易出现癫痫发作且表现可能不典型，成人头痛、癫痫发作相对常见。头痛的程度、发作频率，癫痫发作的类型（如全身性大发作、部分性发作等）等都需要详细询问。
体格检查
神经系统检查：检查患者的意识状态、脑膜刺激征、肌力、肌张力、病理反射等。例如，观察患者是否存在颈项强直等脑膜刺激征表现，检查上下肢肌力是否对称，有无病理征如巴氏征等阳性表现。不同年龄患者神经系统检查结果的解读需考虑其正常发育范围，儿童的神经系统尚未完全发育成熟，与成人正常表现有所不同。
实验室检查
脑脊液检查：
常规检查：囊虫病患者脑脊液压力可能增高，细胞数可轻度增多，多以淋巴细胞为主。不同年龄患者脑脊液细胞数正常范围不同，儿童脑脊液细胞数较成人相对稍高，但一般也在一定范围内，若超出正常范围需考虑脑囊虫病等可能。
生化检查：蛋白含量可能轻度升高，糖和氯化物多正常。
囊虫特异性抗体检测：脑脊液中囊虫抗体阳性对诊断有重要意义。但需注意不同检测方法的敏感性和特异性差异，且可能存在假阳性或假阴性情况。
血液检查：
囊虫抗体检测：血清囊虫抗体阳性有助于诊断，但同样存在假阳性和假阴性问题。例如，免疫功能低下的患者可能出现假阴性结果，而自身免疫性疾病患者可能出现假阳性结果。不同年龄患者的免疫状态不同，儿童免疫功能相对不完善，在解读血液囊虫抗体结果时需综合考虑。
血常规：一般无特异性改变，合并感染时白细胞可升高。
影像学检查
头颅CT检查：
急性期：可见脑实质内点状、片状或环状低密度影，水肿明显，脑室受压变小等。不同年龄患者头颅CT表现可能因脑发育等因素有一定差异，儿童头颅CT的正常结构与成人不同，在判断低密度影等病变时需结合儿童正常脑结构特点。
慢性期：可见钙化灶、脑室系统扩大等。
头颅MRI检查：对脑囊虫病的诊断价值更高，尤其是对于早期病变的检出。MRI可更清晰地显示囊虫的不同时期表现，如囊泡期可见圆形或椭圆形囊性病灶，囊壁薄而光滑，囊内可见点状或头节影；胶样变性期可见病灶呈长T1、长T2信号等。不同年龄患者头颅MRI检查时需注意患儿的配合情况，必要时可能需要镇静等处理以完成检查。
鉴别诊断
与其他颅内病变鉴别：需与脑肿瘤、病毒性脑炎、结核性脑膜炎等疾病鉴别。例如，脑肿瘤一般CT或MRI表现与脑囊虫病不同，肿瘤多有占位效应且强化特点不同；病毒性脑炎脑脊液细胞数可能以淋巴细胞为主，但病毒学检查可明确病因；结核性脑膜炎有结核接触史、脑脊液中蛋白升高更明显、糖和氯化物降低更显著等特点，可通过相关检查进行鉴别。
