尿路感染常见原因包括病原体入侵（如大肠埃希菌等常见致病菌及特定人群的感染情况）、尿路梗阻（泌尿系统结石、畸形致尿液排出不畅利于细菌繁殖）、机体免疫力低下（糖尿病患者及长期用免疫抑制剂者易感染）、医源性因素（留置导尿管及泌尿系统器械检查易引发感染）。
病原体入侵
大肠埃希菌：是尿路感染最常见的致病菌，约占门诊尿路感染的90%和住院尿路感染的50%-70%。女性尿道短而宽，且距离肛门较近，大肠埃希菌更容易由尿道上行至膀胱甚至肾脏引起感染。在性生活活跃期的女性中，由于性活动可将尿道口周围的细菌挤压入膀胱，从而增加尿路感染的风险；而老年女性因雌激素水平降低，阴道和尿道黏膜萎缩，局部抵抗力下降，也易发生大肠埃希菌引起的尿路感染。
其他细菌：肺炎克雷伯菌、变形杆菌、铜绿假单胞菌等也可引起尿路感染，通常在留置导尿管、泌尿系统手术或有泌尿系统结构异常的人群中较为常见。例如，留置导尿管会破坏尿路的防御屏障，使细菌更容易定植，铜绿假单胞菌引起的尿路感染多见于长期留置导尿管或泌尿系统有复杂情况的患者。
尿路梗阻
泌尿系统结石：肾结石、输尿管结石、膀胱结石等泌尿系统结石可引起尿路梗阻，导致尿液排出不畅，尿液在局部积聚，为细菌的生长繁殖提供了有利条件。例如，肾结石堵塞输尿管，使上方尿液潴留，细菌容易在潴留的尿液中滋生，进而引发肾盂肾炎等尿路感染。
泌尿系统畸形：如先天性肾盂输尿管连接部狭窄、多囊肾等泌尿系统畸形，会影响尿液的正常流通，导致尿液引流不畅。以先天性肾盂输尿管连接部狭窄为例，狭窄部位会阻碍尿液从肾脏流入输尿管，造成肾盂内尿液积聚，细菌容易在其中繁殖，引发尿路感染。
机体免疫力低下
糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖水平升高，有利于细菌的生长繁殖，同时机体的免疫功能也会受到影响，白细胞的吞噬功能降低，容易发生尿路感染。据统计，糖尿病患者发生尿路感染的概率比非糖尿病患者高2-3倍。而且，一旦糖尿病患者发生尿路感染，更容易迁延不愈或反复发作，且感染容易扩散引起更严重的感染，如肾盂肾炎甚至败血症等。
长期使用免疫抑制剂者：如器官移植后长期使用糖皮质激素和免疫抑制剂的患者，其机体的免疫防御功能被抑制，对病原体的抵抗力下降，容易发生各种感染，包括尿路感染。这类患者发生尿路感染时，病原体可能更容易扩散，且感染的治疗相对困难，因为免疫抑制剂的使用会影响机体对药物的反应和自身的免疫清除能力。
医源性因素
留置导尿管：留置导尿管是常见的医源性引起尿路感染的因素。导尿管会破坏尿道的黏膜屏障，为细菌进入泌尿系统提供了途径。据研究，单纯留置导尿管3天，尿路感染的发生率约为50%，超过1周，尿路感染的发生率可高达90%以上。例如，因病情需要长期留置导尿管的患者，如脊髓损伤导致尿潴留的患者，几乎都会发生尿路感染。
泌尿系统器械检查：如膀胱镜检查、输尿管镜检查等泌尿系统器械检查，可能会损伤尿路黏膜，导致细菌侵入。在检查过程中，如果器械消毒不严格，还会将外部细菌带入泌尿系统。例如，膀胱镜检查后，部分患者可能会出现短暂的血尿，同时黏膜受损，细菌容易定植，从而引发尿路感染。
