一个人可能会得多次基孔肯雅热，与病毒变异、免疫持续时间有限、不同病毒株感染等有关。
1.病毒变异
基孔肯雅病毒具有较高的变异性。当病毒发生变异后，其表面的抗原结构改变，人体免疫系统之前针对旧病毒产生的抗体，无法有效识别和中和变异后的新病毒，使得免疫保护失效，人就有可能再次被感染。
2.免疫持续时间有限
人体感染基孔肯雅病毒后产生的免疫力并非永久存在。随着时间的推移，体内抗体水平逐渐下降，当抗体浓度降低到一定程度，不足以抵御病毒入侵时，若再次接触该病毒，就可能再次发病。
3.不同病毒株感染
基孔肯雅病毒存在多种不同的病毒株。感染一种病毒株后获得的免疫，对其他不同株的病毒可能没有交叉保护作用，所以接触不同株病毒时，仍有可能再次患上基孔肯雅热。
