细菌性肝脓肿有全身症状如弛张热、乏力、消瘦，局部症状有肝区疼痛、肝脏肿大，还伴消化道症状、黄疸等，儿童表现不典型易被忽视，老年人临床表现隐匿且常合并基础疾病影响预后。
发热：多为弛张热，体温可在38~40℃，伴有寒战，这是由于细菌感染引起机体的免疫反应，致热原作用于体温调节中枢导致。年龄较小的儿童可能体温波动更明显，新生儿可能体温不升。
乏力：因感染消耗机体能量，患者会感觉全身疲倦、无力，影响日常生活和活动耐力，不同年龄人群均可能出现，但儿童可能表现为活动较平时减少等。
消瘦：若病情迁延不愈，长期感染消耗，机体营养摄入不足或代谢紊乱，可出现体重下降、消瘦，尤其慢性病程的患者更易发生。
局部症状
肝区疼痛：多为持续性胀痛或钝痛，可向右肩背部放射，是因为脓肿刺激肝包膜所致。疼痛程度因个体对疼痛的耐受程度及脓肿大小、位置等不同而有差异，儿童表述可能不精确，需结合其他表现综合判断。
肝脏肿大：体检可触及肿大的肝脏，有压痛，肝区叩击痛阳性。肝脏肿大是由于脓肿形成使肝脏体积增大，儿童肝脏相对较大，肿大表现可能更易被发现，但需与其他肝脏疾病鉴别。
伴随症状
消化道症状：可出现恶心、呕吐、食欲不振等，这是因为感染毒素影响胃肠道功能，年龄较小的儿童可能以拒食、呕吐为主要表现，易被误认为消化系统疾病。
黄疸：当脓肿压迫胆道或引起胆管炎时，可出现黄疸，表现为皮肤、巩膜黄染，血中胆红素升高。新生儿及婴幼儿由于肝脏代谢和排泄功能相对不完善，黄疸表现可能更需警惕。
不同人群表现特点
儿童
儿童细菌性肝脓肿临床表现可能不典型，发热可不规律，肝区疼痛表述不清，易被忽视。还可能出现嗜睡、哭闹不安等精神状态改变，因为儿童对感染的耐受及反应与成人不同，且免疫系统发育不完善，感染易扩散。
老年人
老年人机体功能衰退，免疫功能低下，临床表现可能较隐匿，发热可能不高，局部症状也不典型，易延误诊断。同时老年人常合并基础疾病，如糖尿病等，会影响病情发展和预后，需特别注意基础疾病的控制对肝脓肿治疗的影响。
